神经外科是集医疗、教学、科研为一体的临床学科。现有医师十四名，其中博士1人，硕士6人。科主任虞昊现任南通市神经外科副主任委员，江苏省神经外科委员，江苏省中西医结合神经外科委员。床位七十张，其中重症监护床位十二张。目前科室拥有超高清Storz内镜、卡尔蔡司显微镜等先进的手术设备，常规开展脑膜瘤、胶质瘤、垂体瘤、慢性硬膜下血肿、脑出血、颅脑创伤等手术，其中颅脑创伤在全市的颅脑创伤救治中处于领先地位。多位医师先后在北京天坛医院、上海华山医院、上海中山医院、瑞金医院进修学习，学习神经外科先进技术并运用于南通市民的颅脑疾病的救治，取得了一定的成绩。近三年来，获得南通市科技进步奖二项，其中二等奖一项、三等奖一项，主持省、市级科技计划项目五项。科室近三年来获得国家专利十余项，发表SCI十余篇、国家统计源或核心期刊及省级以上杂志达三十余篇，目前正参与编写专著一部。

该科常规接收临床进修医生，并承担南通医学院临床医学本科、预防医学本科、影像医学本科等专业学生的颅脑创伤及肿瘤的教学任务。

该专科已形成合理的人才梯队，科教研各方面在省内及市内同领域中具备了一定的实力和区域影响力，并且有一定的学术地位。