重庆医科大学附属儿童医院新生儿科始建于1980年，2000年科室建立新生儿转运系统（NETS），被重庆市卫生局正式批准为“重庆地区危重新生儿及早产儿急救监护中心”。2008年成立“新生儿诊治中心”。中心是由新生儿重症监护室（NICU），早产儿室、新生儿普通病房、新生儿急救转运及新生儿专科门诊组成的特色专科；2010年获“重庆市重点学科”；2011年获“国家级临床重点专科”。
新生儿诊治中心是重庆医科大学最早的博士学位授予点之一，目前有专科医生36名，其中正高职称4名，副高职称4名，中级职称8名；博士导师1名，硕士导师8名；博士后1名，博士11名，在读博士生2名；硕士21名，在读硕士1名；本科4名；专科护士165名，副主任护师1名，主管护师14名，护师31名；研究生1名；在读研究生2名；本科114名，大专51名。数年来获省市级科技成果二等奖2次，三等奖5次，厅局级科技成果二等奖3次，先后承担并完成国家自然科学基金项目课题14项，省级科研项目15项，厅局级项目8项。获外向型科研经费500余万元。发表论文450余篇，其中被SCI收录20余篇。参编著作及教材40余部。获国家专利7项，培养博士后1名、博士研究生10余名、硕士研究生近120余名。
中心学术带头人余加林教授现任中华医学会围产医学分会常务委员、中华医学会儿科学分会新生儿学副组长、中华医学会重庆市医学分会围产医学专业委员会首任及现任主任委员、中华医学会重庆市医学分会儿科学专业委员会委员及新生儿学组组长、中华医学科技奖第三届评审委员会委员、中华医学会医疗事故技术鉴定专家库成员、中国医师协会新生儿专业委员会第一届感染专家委员会副主任委员、中国医师协会新生儿专业委员会第一届委员会顾问、中国妇幼保健协会新生儿保健专业专家委员会顾问委员会委员。重庆市首批学科带头人后备人选、重庆市首批高校中青年骨干教师资助对象，新生儿窒息复苏国家级教员。《中华儿科杂志》、《中国当代儿科杂志》、《中国实用儿科杂志》、《实用儿科临床杂志》、《中国循证儿科杂志》、《临床儿科杂志》、《重庆医学》、《小儿急救医学》等编委、《中华全科医师杂志》特约审稿人、《儿科药学杂志》常务编委。
中心其他骨干人员分别担任中华医学会重庆市医学分会围产医学专业委员会委员、秘书；中华医学会重庆市医学分会儿科学专业委员会委员、秘书；中华医学会重庆市医学分会儿科学专业委员会新生儿学组副组长、秘书及成员；中国医师协会新生儿专业委员会第一届营养专家委员会委员；中国医师协会新生儿专业委员会神经专家委员会；中国医师协会新生儿专业委员会兼感染专家委员会委员；重庆市中西医结合学会第三届儿科专委会副主任委员、常务委员；重庆市儿童康复专业委员会委员；重庆市预防接种异常反应（AEFI）调查诊断专家组成员；中华医学会医疗事故技术鉴定专家库成员；重庆市渝中区医学会医疗事故技术鉴定专家库成员；重庆市营养学会（妇幼营养专业委员会）会员；重庆市沙坪坝区儿科医疗质量控制中心指导专家；《儿科药学杂志》特约审稿人。
中心以新生儿细菌感染为主要研究方向，早产儿综合治疗与监护、新生儿脑损伤的预防诊断和治疗等研究齐头并进。主要诊治新生儿肺炎、黄疸、脑损伤等常见疾病。对早产儿及其常见并发症，如呼吸衰竭、低体温、硬肿症、早产儿喂养及静脉营养、肺透明膜病、坏死性小肠结肠炎、脓毒血症等危重疾病，均已建立一整套较完善可行的诊治方案。还参加了有关疾病治疗的全国协作科研。1999年加入国家“九五”攻关项目协作组，正式启用缺氧缺血性脑病（HIE）规范化治疗方案，并开展对HIE患儿的新生儿行为测定（NBNA）、发育商（DQ）测定，其作用在于了解患儿智能、运动发育情况以利于早期干预。现已形成一整套与国内外专科水平相当的新生儿现场急救措施；新生儿重症监护室（NICU）配有吊塔、中心供氧、中心吸引，高级暖箱、新生儿高频振荡通气机和常频呼吸机、床旁血气分析仪、T-组合复苏器、振幅整合脑电图（aEEG）等设备。我中心在西部地区率先开展了双管同步换血、高频振荡通气、早产儿的脐动静脉置管以及新生儿JGB2基因临床筛查等临床新技术，并拥有新生儿缺氧缺血性脑病、脑损伤数据库，对脑损伤早期发现和随访病人在西部有相当的影响，年收治新生儿数达8000例，年转运重庆及周边地区危重新生儿达1800人次。在重庆市围产医学领域更好的产儿合作提供了全国一流的技术支撑。
中心每年定期举办“新生儿骨干医师学习班”2期，已举办53期，共培训进修医生1200余名，学员遍及全国各地20多个省、市、自治区。已举办“NICU专科护士培训班”5期，培养NICU专科护士300余名。举办6次国家级继续医学基地项目，全国各地共500余人次参加。
中心拥有专业的新生儿疾病实验室，拥有临床分子生物实验室、细胞培养室、生物安全二级实验室（P2）等科研平台，长期有30名研究生及研究人员在此平台上工作，已培养约100名新生儿专业研究人员。
在国际学术交流方面，与来自澳大利亚、英国、加拿大、香港等国家和地区的新生儿专家组成的国际医疗服务队（MSI）已经有十多年的合作，以国际著名的新生儿专家余宇熙教授为领队的团队每年定期到中心进行学术交流，并组织了针对重庆市基层医院同行的学术讲座。中心也派一名教授去澳大利亚高级访问。从去年开始，又与德国、日本、法国及美国的同行建立了联系并来医院进行学术交流。近三年已举办2次新生儿国际学术会议，邀请来自德国、英国、加拿大、日本、香港等新生儿专家进行讲座。已经成为重庆市新生儿学国际交流的平台和窗口。
