上海儿童医学中心眼科主要针对0-18周岁儿童和青少年的眼部疾病，开展相关的临床医疗、教学和科研工作。目前建立了斜弱视、眼视光、泪道、眼整形、眼表、眼底等多个亚专业，是国内小儿眼科亚专业种类较为齐全和成熟的团队之一。

眼科团队在斜视、眼球震颤、眼睑内翻倒睫、小睑裂综合征、泪道探通、泪道置管、上睑下垂、眼睑肿物及眼眶肿物等疾病的手术治疗中积累了丰富的临床经验。团队已累计完成约1万8千例斜视、眼球震颤手术，尤其擅长各种疑难的斜视、眼球震颤手术。用整形美容标准对眼睑内翻倒睫和上睑下垂行手术矫正，取得了非常满意的手术效果。弱视的综合治疗、近视的防控手段都紧跟国内外最新进展，力求为患儿提供最佳的治疗方案。目前已完成约3500例OK镜的验配，尤其对于疑难的OK镜验配方面积累了丰富的经验。同时，借助综合医院的优势，开展早产儿、新生儿及低年龄儿童眼底相关疾病诊治工作已有10余年，累计发现并确诊100余例眼底疾病。

上海儿童医学中心眼科长期与国内外多家知名医院眼科保持密切的交流和合作关系，开展远程诊疗，开通多地眼科诊疗绿色通道等。各亚专业医师均接受过中长期临床专业培训，多名成员拥有国内专业协会资质认证，掌握本领域国际最新研究动态和技术，在罕见疑难病例的诊断和治疗上发挥了出色的作用。