巴彦淖尔市中医医院针灸科多年来积极挖掘中医文化精髓，发挥中医特色优势，引进全盟先进的艾灸排烟设备。主要运用传统的温针灸、艾灸，结合现代医疗科技技术贯彻以“整体观念、辨证论治”为基础，以“古为今用，洋为中用”的原则，运用中药内服、外用，治疗因中风引起的肢体偏瘫、麻木、疼痛、半身不遂、口眼歪斜、颈椎病、腰椎病、网球肘、骨关节肿痛、骨关节病等风寒湿痹症效果显著。运用放血、火针治疗配合拔罐治疗带状疱疹等方面疗效显著。运用局部的艾灸、中药、熏蒸治疗多年的腰椎间盘突出症、颈椎病肩周炎、风湿、类风湿性关节炎、强直性脊柱炎、退行性关节痛、各种软组织损伤疗效独特。

该科刘慧林主任自创的一种“斜圆刃针”经国家知识产权局审查授予新型实用专利证书，在临床运用中对各类疼痛缓解效果显著。

该科运用中药内服治疗小儿感冒、失眠、血栓闭塞性脉管炎、慢性结肠炎、痛经、慢性盆腔炎等内外妇儿科等疑难杂症疗效显著。