巴彦淖尔市中医医院脾胃病科是巴彦淖尔市市级重点专科，以中西医结合、针药结合、病症结合、治疗与调摄结合、传统与现代结合五个结合为特色。目前开放床位32张，门诊2间，幽门螺旋杆菌检测室1间，中医治疗室1间。现有高级职称医师2名，中级职称医师2名，住院医师2名。

脾胃病科秉承中医传统，立足辨证，结合现代医学，取长补短，以患者为中心，疾病为导向，应用中西医结合手段提升疗效，成为具有中医传统特色的现代临床科室。

科室主要诊治各种脾胃相关疾病。例如：反酸、胃痛、胃痞、泄泻、呕吐、呃逆、腹痛、便秘、黄疸、臌胀等;西医对应疾病有：胃食管反流病，食管炎，慢性胃炎(包括萎缩性胃炎)，十二指肠炎，消化性溃疡，消化道出血，胃息肉镜下摘除，胃粘膜早癌镜下治疗，急、慢性胰腺炎，急、慢性胆囊炎，急、慢性病毒性肝炎，酒精性肝炎，非酒精性肝炎，肝硬化及合并症，溃疡性结肠炎，结肠息肉镜下治疗以及功能性烧心、反流高敏感、肠易激综合征、功能性腹泻等消化系统功能性疾病。

科室常年开展内镜粘膜切除术(EMR)、内镜氩离子凝固术(APC)、内镜下息肉咬除术、内镜下息肉高频电切术以及内镜下止血、内镜下上消化异物取出等。

科室开展的中医特色治疗项目有：针刺疗法，艾灸疗法，中药封包，穴位贴敷，穴位注射，中药泡洗，穴位埋线，红外线照射，火罐，走罐，耳穴压豆，推拿按摩等。