中山二院眼科具有光荣的历史，是国际著名十大眼科中心之一中山眼科中心的前身，我国已故的著名眼科专家陈耀真、毛文书教授曾在这里工作。眼科除了完成常规的专科医疗任务外，还承担了各科室的会诊以及医学系、口腔系和下级医院进修生的教学工作。眼科有住院病床20张，每年眼科出诊近4万人次（不包括眼科急诊数），每年收治患者约400多人次。年出诊量和年收入在广州市综合医院眼科排名前3位。科室有医务人员24人，其中正教授1人，副教授、副主任医师6人，主治医师、讲师2人，初级职称2人，技术员1人；硕士生导师2人，博士学位2人，硕士学位3人，在读博士、硕士研究生3人。在完成各种常见眼病诊治的基础上，开设了青光眼、白内障、近视眼防治、角膜病、儿童眼保健、糖尿病眼病、泪道病、眼肌病、视网膜脱离、眼底、眼与全身病等专科和教授出诊。除能开展各种常见的内外眼手术外，近年来引进先进仪器和设备开展了多项先进的检查及手术治疗。
专科特色1．青光眼：目前科室有2名青光眼专业博士，2名青光眼专业硕士。科室现配备了先进的全自动视野检查分析系统、视觉电生理检查仪、非接触眼压计、Goldmann压平眼压计、YAG激光等，开展了青光眼复合式小梁切除术、周边虹膜切除术、睫状体冷凝术等可进行常规青光眼和大部分难治性青光眼的诊治。
2．近视眼防治、儿童眼保健：配备了最先进的德国蔡司Mel-80准分子激光治疗仪、日本TOPCON综合验光仪、自动验光仪、超声角膜测厚仪、日本TOPCON角膜地形图检查仪，近两年来完成近3000眼准分子激光治疗近视。为广东省最先开展有晶体眼前房型人工晶体治疗超高度近视的单位之一，已完成该治疗30多例，有三名副高以上人员从事儿童眼保健的防治工作，可开展常规的眼外肌手术。目前医学验光弥补了普通验光的不足。
3．白内障：有1名白内障专业博士，一名副主任医师曾在俄罗斯眼显微外科中心做访问学者。配备了先进德国蔡司S8型手术显微镜，美国AMOSOVERGN白内障超声乳化治疗仪，眼科A/B超等，可开展白内障囊内摘除、现代白内障囊外摘除及后房型人工晶体植入术、小切口白内障囊外摘除及可折叠人工晶体植入术、白内障超声乳化摘除及可折叠人工晶体植入术，二期人工晶体植入术、前房型人工晶体植入术、YAG激光后发障切开术。
4．眼底病：配备了德国蔡司眼底照相和荧光血管造影系统、法国罗兰多焦视觉电生理检查分析仪（广东省不到五家医院配备）、法国光太眼底激光、眼科冷冻治疗仪等。开展了眼底病视网膜光凝治疗、外路视网膜脱离复位术、中西医综合治疗眼底病。近来还开展了最新的光动力学疗法治疗湿性老年性黄斑变性。
5．泪器病和干眼征：可开展泪囊摘除术、泪道浚通术，泪道植管术等、近年与耳鼻喉科联合开展鼻内窥镜下泪囊造口术30多例，效果良好，对先天性泪囊炎和慢性泪囊炎的诊治经验丰富。
6．葡萄膜炎：利用综合医院优势，与风湿免疫科、中医科、理疗科等密切合作，采用中西医结合的方法治疗虹膜睫状体炎、中间和后葡萄膜炎。
7．甲亢突眼和炎性假瘤：与内科、放疗科、核医学科密切合作，积累了较丰富的临床诊治经验，为广东省最早开展甲状腺相关性免疫眼眶病放射治疗的单位之一，对放射治疗炎性假瘤也有较深的体会。
8．眼肿瘤和眼整形：可开展眼球摘除加义眼座植入术、眼睑肿物眼眶内肿物摘除术，翼状胬肉切除并羊膜移植术、上睑下垂矫正术、重睑成形及多种眼部畸形矫正术等。
