民族医学科原名中医科，成立于1947年建院之初，是“北京市综合医院示范中医科”首批挂牌认证单位之一，2011年被授予“全国综合医院中医工作示范单位”。2014年被评为北京市民族医学重点专科，现承担四项科研项目。

民族医学科以“继承中医，发展回医，服务民众”为发展理念，现拥有数位中医专家，学术力量雄厚。学科带头人刘亚军主任医师完成了北京市中医管理局125人才工程培养。2009年经北京市中医管理局批准，分别建立了“3+3”薪火传承汤嗣标老中医基层工作室和杨大绮老中医基层工作室。曾担任医院副院长的王春生主任在2011年、2012年分别担任北京市第四批名和全国第五批名老中医专家学术继承指导老师。2012年设立了王春生工作室，现有五名学术传承人参与工作室的建设工作。

现设有病房、门诊、针灸科及回医特色诊疗中心几个部门，拥有医师21名，其中主任医师3名，副主任医师4名，主治医师7名，住院医师7名。具有硕士学位9名，博士学位1名。

民族医学科病房成立于1991年，现开放病床30张，主要收治的病种有：脑梗死恢复期、糖尿病、冠心病等内科常见病，均采用中西医结合的治疗方式。尤其是治疗中风病（脑梗死恢复期）方面优势明显，采用“四位一体”的治疗方法，即：中药饮片、中医针灸、康复训练治疗、中药泡洗四种手段综合治疗；除此以外，科室还开展了搦药、中药穴位贴敷、耳穴压豆、刮痧的治疗方法，并引进了温热电针灸治疗仪、脑循环治疗仪等仪器设备，疗效显著。自2013年以来，科室开展养生药膳研究，根据患者体质的不用，制定相应的养生药膳计划，为患者提供适合其体质的膳食指导，并为住院患者免费提供养生茶。

针灸科是以中医，民族医学相结合技术全面为著的科室。现拥有子午流注治疗仪、微电脑脉冲治疗仪、腿浴治疗器，超声药物导入治疗仪等先进设备。开展各种针灸疗法，并逐渐形成了治疗神经损伤，疼痛，骨关节病，脏腑功能失调等专科特色。

回医药特色诊疗中心设有回医专家门诊、回医特色皮科门诊、回医养生咨询门诊。回医特色皮科门诊应用中西医结合的方法治疗各种常见皮肤病，开设过敏原（特异性IgE）检测、皮肤斑贴试验、伍德灯检查、真菌、疥虫及蠕形螨显微镜检查；同时配备高能量二氧化碳激光、液氮冷冻等设备，治疗皮肤赘生物及良性皮肤肿瘤；采用药物面膜辅助治疗颜面部损容性皮肤病，疗效满意。回医养生咨询门诊根据治未病理念，根据患者体质，制定个体化的回医食疗养生方法，预防疾病进一步发生和发展。诊疗中心开设针刀闭合性手术，与传统的小针刀疗法不同，将回医特色割治术应用其中，对疼痛患者，运用中西医结合理论，松解粘连的肌肉和筋膜，能明显改善和缓解患者的疼痛。