内分泌代谢科于1995年成立治疗小组，2001年独立成科。经过24年的不懈努力，科室现已发展成为集临床、科研、教学、预防为一体的综合性学科，主要从事糖尿病、甲状腺、骨质疏松、痛风、肥胖、肾上腺等内分泌代谢疾病的临床、科研、教学、预防工作。目前抚河院区开设病床60张，朝阳院区病床46张，专科医师18名、护理人员35名，其中博士3名、硕士研究生13名、糖尿病护理专科护士1人、糖尿病教育护士2名、国际伤口治疗护士1名、足病护士1名，公共营养师8名。
临床诊疗：2003年起采用胰岛素泵及双C治疗；2005年省内***开展线粒体基因突变检测技术；2005年临床广泛开展甲状腺微创治疗技术，针对不同甲状腺疾病采取个性化治疗方案；2007年建立糖尿病患者门诊电子档案数据库，将患者资料纳入规范化常态管理；2008年开设骨质疏松专科门诊；2009年开展针灸治疗肥胖2型糖尿病及慢性并发症；2013年开展糖尿病下肢血管病变微创介入治疗；2014年开展糖尿病足病特色治疗；2015年建立一站式门诊，并开设甲状腺、骨质疏松、痛风、肥胖、营养、风湿病等专病门诊。2017年成为北京市糖尿病协会控糖卫士远程管理基地，通过京赣糖尿病远程协作中心项目，对接基层单位糖尿病远程会诊工作；2018年正式成立骨质疏松与骨关节病专科，对骨质疏松患者推行规范化治疗。科室先后诊治了垂体危象、低磷骨软化、肾小管酸中毒、假性甲旁减、肢端肥大症、肾上腺腺瘤等内分泌疑难疾病，在糖尿病酮症酸中毒、高渗性非酮症糖尿病昏迷等急危重症的救治方面累积了丰富的经验。
科研开展：2003-2005年在江西省内首次开展了线粒体基因突变糖尿病研究暨糖尿病家系筛查，对全省128个2型糖尿病家系共1400余人进行调查，研究成果获南昌市科技进步三等奖。2005-2007年在南昌市西湖区13个社区5万多居民开展了糖尿病及代谢综合征人群的流行病调查，研究成果曾被江西省疾病预防控制中心采纳引用，代表江西省数据上报国家卫计委，成果分别获得南昌市科技进步二等奖及三等奖。2008-2010年分别对江西地区共计2000余社区人群开展了骨质疏松患病调查研究，建立江西健康人群骨量数据库，填补了江西省空白，经江西省科技厅组织专家鉴定，成果达国内领先水平，并获得民政部“十一·五”期间老年学骨质疏松研究科技创新奖，南昌市科技进步三等奖。2010年建立南昌市糖尿病重点实验室，组建了生物标本库。2010-2012年卫生部疾病预防控制局批准成为中国“糖尿病一体化管理”示范基地，进行了5000多例糖尿病高危人群筛查，对2000多例糖尿病患者进行系统化管理，分别被卫生部、省科技厅、省卫生厅、南昌市卫生局纳入基层和农村医疗卫生适宜技术推广项目及江西省成果转化推广项目，成果获南昌市科技进步一等奖。2012-2014年在全市多个社区开展了2000多人的绝经后骨质疏松症遗传基因研究，经省科技厅组织专家鉴定，研究成果达国际先进水平，分别获江西省科技进步三等奖，南昌市科技进步二等奖。2017年开展国家重点研发项目“重大非传染性疾病研究项目”子课题项目《2H-UG联合FPG、AGDsP单独或联合FPG在江西汉族人群糖尿病复查诊断中的价值》，对南昌市西湖区1200多人进行糖尿病筛查及相关指标检测，数据分析正在整理中。2018年开展江西省科技厅重点研发计划重点项目《新诊断2型糖尿病及前期人群精准干预与治疗研究》，对江西省南昌市、赣州市、九江市、萍乡市、抚州市、鹰潭市等地市4900多人群进行了糖尿病流行病学调查，目前正在进行干预研究。
2019年该院建有标准化代谢病管理中心（MMC），对糖尿病和肥胖患者进行长期的中心化、标准化、一站式服务，延缓慢性并发症的发生发展，提高患者的生活质量；并成为上海市瑞金医院宁光院士团队定点研究单位，参与开展中国成人2型糖尿病降压目标研究（BPROAD），进行为期5年的糖尿病、高血压规范管理，目前已入组276例。
近5年获得国家自然科学基金3项，国家级、省部级、地厅级科研项目40多项，其中1项达国际先进水平，7项达国内领先水平，分别获江西省科技进步三等奖1项、南昌市科技进步一等奖1项、二等奖4项、三等奖3项。发表学术论文100余篇，其中SCI论文20篇。
科室荣誉2016年荣获国家代谢疾病临床医学研究中心协同研究网络成员单位
2010年荣获卫生部“中国糖尿病一体化管理模式”推广示范基地
2010年荣获卫生部医疗质量万里行--骨质疏松诊疗技术协作基地
