呼吸与危重症医学科是衢州市医学重点学科，拥有高级职称8人，硕士6人，市115人才2人，市级名医1人。下设呼吸重症监护室（RICU），纤维支气管镜检查室、睡眠监测室、肺功能室等。配备有德国Drag呼吸机、美国伟康无创呼吸机和伟康多导睡眠监测仪、德国耶格肺功能仪，奥林巴斯和宾得纤维支气管镜，微波治疗仪及百康生物共振治疗仪和多台多功能监护仪、动态血氧监测仪等先进设备。

在市内率先开展了多导联睡眠监测和睡眠呼吸暂停综合征的诊治、TBNA、纤维支气管镜下的内膜结核治疗和肿瘤介入治疗、经皮穿刺肺活检术、过敏性疾病的诊断和脱敏治疗及纤维支气管镜下的冷冻等介入治疗，尤其在危重病人的诊治方面有较大突破，开展气道激发试验，提高临床上不明原因的呼吸困难、哮喘和慢性咳嗽的诊断，判断哮喘的治疗效果。近年来，科室在慢性阻塞性肺病、哮喘、呼吸衰竭、肺部感染性疾病、胸腔积液、自发性气胸等疾病的诊治方面积累了丰富的经验，并在肺部肿瘤的综合诊治和弥漫性实质性肺疾病的诊治上取得了长足的进步。