神经外科是衢州市医学重点学科，承担着衢州地区神经外科学术活动、临床研究和危重疑难病会诊中心等医学任务。拥有高级职称10人，硕士生导师1人，硕士6人。其中微创神经外科、脑血管病、脑肿瘤和功能神经外科方面学科带头人4人，市级名医3名。科室配备高清多功能手术显微镜、高清神经内镜、神经手术导航系统、脑立体定向手术系统、多功能监护设备、人工呼吸机、多功能颅内压监护仪、脑电监护仪、全自动降温仪等先进手术设备及监护治疗仪器。

开展神经创伤、颅脑肿瘤、脑血管病、颅内感染性疾病和脑先天性、功能性病变等神经外科全领域疾病的治疗，并开设脑肿瘤、脑血管病等亚专科门诊。掌握重型颅脑创伤综合治疗、脑血管病介入治疗、脑内窥镜治疗等特色技术，绝大部分脑肿瘤均能在手术显微镜下或神经内镜下完成，达到了较高的治疗水平。科室与上海华山医院、长征医院、仁济医院及省内浙大一院、浙大二院神经外科有着密切的业务联系，是浙江省神经外科联盟成员单位，浙大二院张建民、陈高团队专家工作站。