成立于20世纪80年代，90年代初组建心胸外科，是一个以心胸外科临床医学为主，医疗、教学、科研相结合的专业性学科。目前拥有一个病区，51张床位，年住院病人1500余人次，手术人次500台左右，收治肺癌、食道癌、心脏病等病患，系绍兴市心脏病学科临床、教学与科研中心。在编临床医师9名；其中主任医师2名，副主任医师5名，其中硕士研究生导师1名，博士1名、硕士1名、研究生5名。
学术地位开展了多项基础研究和临床工作，近年来已在《欧洲心胸外科学杂志》、《中华心胸血管外科杂志》、《中华创伤外科杂志》等核心期刊发表论文多篇，获得省、市自然科学优秀论文奖一、二等奖多次，绍兴市科学技术进步二、三等奖多次。并于2010年创建绍兴市心胸外科学会。
该科特色一、以常见心胸外科疾病如先天性心脏病、风湿性心脏瓣膜病、冠心病、大血管病变、肺癌、食道癌、气胸、纵隔肿瘤，严重胸外伤等诊断和治疗为基础，以治疗肺、食管恶性肿瘤及微创技术为主要研究方向，先后诊治多种国内罕见的疑难病例。
二、八十年代开展该市首例体外循环下心脏手术，90年代后期在该市率先开展胸腔镜外科手术并取得了良好的疗效。2004年开始开展大血管手术，2005年始开展冠脉搭桥手术，取得良好疗效。
三、开展新的治疗手段和方法治疗疑难杂症，特别是分子靶向治疗肺癌、射频消融治疗房颤、胸腔镜下肺叶切除术，取得较好效果。
研究方向胸腔镜下肺癌根治术的广泛开展；肺癌的个体化治疗，应用分子靶向药物或新的化疗组合方案提高恶性肿瘤的完全缓解率；开胸手术中射频消融治疗房颤。
教育培训承担各级医院的进修生、各校院实习生、见习生的临床带教工作
服务理念全心全意为病人服务。
