南通市中医院骨伤科为一级科室。现有病床60张，年收治病人1000多人，年门诊人次2万余人。专科有主任医师3人，副主任医师4人，主治医师4人，住院医师4人，其实硕士5人。骨伤科从建科至今，已走过了三十多个春秋。三十多年来在院领导的关怀下，在全科几代医护人员的共同努力下，科室走过了规模从小到大，人员从少到多，技术力量从弱到强的程度。现已经发展成为南通地区较具影响力的特色专科，在医教研多方面取得了丰硕的成果。2006年一项科研成果获南通市科技进步三等奖。
骨伤科是南通市成立最早的骨伤专科之一，有着明显的中医特色，在应用传统正骨手法整复，小夹板固定，中药外敷内服治疗骨折，脱位，软组织损伤及骨病方面在本地处于领先地位。最早在80年代初我科就率先在南通地区展开了麻醉下推拿治疗椎间盘突出症，积累了2000余例病例，疗效达70%。自制的正骨丹、和伤散、余芙膏、芙黄膏等一系列方药用之临床，如鼓应桴效果颇佳，深受广大患者的称赞。与此同时，我们在保持中医骨伤传统特色的基础上，不断创新，走中西医结合的道路，开展了“三甲”医院的一系列的手术，使骨科疾患的治愈率明显提高，许多疑难疾病得到治愈，所展开的多项诊疗技术处于省内领先水平。
主要特色包括以下几方面：1、脊柱外科：开展多种脊柱脊髓损伤，脊柱肿瘤，脊柱结核，颈椎病，腰椎间盘突出症，腰椎滑脱，脊柱侧凸等脊柱病变诊治，尤其在复位颈椎和腰椎段脊柱病变的手术治疗上居于省内领先水平。
2、关节外科：已大量开展肩关节，髋关节，膝关节人工关节置换术，并取得良好的效果，其中小切口人工全髋置换术及髋关节表面置换术为我市首例开展。
3、创伤外科：以中西医结合为其特色，对促进骨折愈合，预防骨折病，加速肢体康复有明显优势，以多种方法开展多种复杂骨折的治疗。如：解剖钛板、交锁髓内钉、外固定支架等。
4、关节镜：开展多种关节镜下滑膜切除、半月板切除及修复，交叉韧带损伤的修复等手术。
5、手外科及显微外科：开展多种臂丛神经及周围神经损伤的诊治，断肢（指）再植，足趾移植，拇指再造，多种游离带血管蒂皮瓣转移术治疗多种组织损伤。
6、矫形外科：开展儿童及成人股骨头缺血性坏死及多种先天性疾病如先天性髋关节脱位、先天性马蹄内翻足等多种肢体畸形矫形手术治疗。
