南通大学附属医院神经内科在苏中苏北地区享有较高的声誉。现为江苏省重点医学专科培育单位，江苏省卫生厅重点临床专科，国家药物临床试验基地。集医疗、教学和科研于一体。科室拥有三甲医院应具备的神经影像学、神经电生理和血液流变学和血管超声学等临床研究设备。现拥有44张住院床位，6张急诊床位。专科床位利用率95%，专科年门诊人次33500左右，专科年出院人次1600人左右，治愈好转率超过98%。每年接受它他院转诊率15.5%。

神经内科一直注重人员素质建设、继续教育和医、教、研综合能力的提高。已基本建成素质高、能力强、年龄结构合理的医师队伍。科内在职医师23名，职称结构：正高7名，副高5名，中级8名，初级3名。学历结构：博士2名，硕士16名，硕士学历69.6%。

神经内科对脑血管病的基础与临床研究、中药抗神经元老化、痴呆的神经电生理以及神经心理研究做了较多的工作。对苏北地区神经科疑难危重病人诊断与治疗进行指导与参与，使之成功率大为提高。对蛛网膜下腔出血的病因筛选以及缺血性脑血管病血管内治疗、中枢神经系统感染、重症肌无力、吉兰巴雷综合征等疾病的诊断与治疗较有特色。开设帕金森、痴呆、颠痫、头痛专病门诊，满足特殊人群的需要。

在临床方面，作为苏北地区医疗中心，每年医治大量的神经系统疑难杂症、危重病患者，以收进来、走出去的方法，解决广大患者及下级医院的需求，在神经系统变性疾病的诊断以及神经系统感染性疾病的诊断治疗中形成自己特色优势，开设有癫痫、痴呆、帕金森病和头痛等专科门诊，功能检查室所拥有的视频脑电、动态脑电、常规脑电、诱发电、肌电、眼震电图、脑血流动力学检查及血管形态学检查为临床工作提供很好的保证。从上世纪90年代末开展的血管内治疗，科室是国内较早开展这方面工作的专科，颅内外血管支架成形术、动脉瘤栓塞术及急性脑梗死动静脉联合溶栓治疗等技术的开展，使科室血管疾病治疗方面形成特色，该技术获2004年省卫生厅新技术引进二等奖。对已失去溶栓机会的患者，如何在急性期应用降纤、抗凝、抗血小板聚集联合治疗也成为他们的亮点。04年该科神经重症监护病房的开通，为该科治疗神经系统重症患者提供了基础，也为该科对神经重症监护理论研究与经验总结提供了平台。

神经内科承担南通大学临床医学院所有神经病学及医学心理学的教学任务，在本科生、研究生教学中，理论和实践结合，保持教学内容与国际研究水平同步。全科共发表论文近百篇。获得科技进步奖和市技术进步奖各一项，承担省、市科研课题5项。近几年共培养硕士研究生22名，接受进修人员数18人。