江苏省中医院眼科组建于1958年，经过数代人的艰苦奋斗，继承创新，眼科已成为具有祖国医学特色和优势，并吸收现代医学最新技术，融科普教育与远程会诊为一体，具有现代医学模式，集高科技、高水平、多特色的中西医结合的眼科中心。
眼科中心在中西医结合眼底病的诊断与治疗的研究上，不断引入现代医学的检查方法：如共焦激光眼底扫描系统，OCT、免散瞳眼底照相机、眼科A/B超、视野、眼电生理、角膜地形图、波前像差仪等，通过长期临床实践，进一步充实和发展眼底辨证体系，逐步建立起了客观、对临床有重要指导价值的现代眼底辨证体系。治疗上，继续采用传统医学疗法如中药、针灸，并及时引进和开展新技术、新疗法，如多波长氪激光视网膜光凝，玻璃体视网膜手术，PDT治疗及TTT治疗等用语药物无法救治的眼底病，挽救了部分患者宝贵的视功能。其中共焦激光眼底扫描系统、PDT治疗及TTT等诊治方法均有华东地区首次开展。在南京地区率先开展了PRK手术，在全省率先开展了ISAIK。率先在国内开展了准分子激光个体化角膜切削术、率先在国内开展了白内障超声乳化手术和玻璃体视网膜手术，开展的青光眼小梁切除术和引流阀植入术，开展了斜视手术和泪道逆行置管术等手术。
眼科为全国中医眼科及中西医眼科博士点、省级重点临床专科。承担课题共15项，其中国家级课题4项，部省级课题2项，厅局级课题9项，已鉴定课题有1项获省中医药科技进步一等奖，1项获科学技术进步三等奖。
