长海医院风湿免疫科于1997年正式成立（1989年成立风湿组，隶属肾内科），是国内三级甲等医院中成立较早的特色科室。现为国家卫计委风湿免疫专科医师培训基地、卫计委风湿专业组临床药物试验基地、卫计委骨质疏松诊疗技术协作基地、卫计委骨质疏松试验基地，科室连续4年（2009-2013年）入选复旦大学版中国医院最佳专科（风湿科）声誉排行榜提名。

学科建成了一支以中青年为主、德才兼备、梯次合理的学术队伍，医护人员28名，医生15名，（教授3名、副教授1名、中级6名、初级5名），拥有上海市优秀学科带头人、校育才银奖等人才。现有博导1名，硕导3名。培养博士8名、硕士27人，现在读博士5名、硕士5名。在12种专业学会和10种学术期刊上任职35人次，最高任职为全国常委（3项）、上海市副主委（3项）。长海医院全面建设优胜科室，医疗效率优胜科室，医德医风优胜科室，集体嘉奖，集体三等功等15项荣誉称号。承担国家、上海市等科研课题29项，包括国家“十一五”支撑项目、863、973分课题，国家自然科学基金，上海市科委重大、重点课题，十五、十一五、十二五基金等，总计1270万元。获国家发明专利2项，科技进步二等奖2项，医疗成果二等奖3项，科技进步三等奖1项、医疗成果三等奖5项、上海市医学科技奖3项。在国内外核心期刊共发表论著130篇，其中SCI收录30篇，累计影响因子90余分。主编出版专著13部。

开设特需门诊、专家门诊和普通全日候门诊，年门诊量约7万余人次，年收治病人近2000人次。

1．痛风诊治：为科室最具特色和创新的诊治领域。拥有国内首台偏振光显微镜，结合最新技术双能CT提高痛风诊断的敏感性和特异性，属国际领先。首创急性痛风2-4小时不痛的快速止痛消肿疗法，以及首开常规治疗（NSAIDs、秋水仙碱、激素）无效而采用强效生物制剂（包括IL-1单抗）治疗急性痛风，属国内领先。开展少量或有限控制饮食而采用非布司他等新兴降尿酸药物的达标治疗，以及常规采用预防发作等综合防治手段，实现尿酸盐晶体早期诊断和难治性痛风的优化治疗，属国内先进、上海市领先。

2．类风湿关节炎诊治：开展生物制剂治疗传统DMARDs无效患者的登记注册研究，长期随访例数、疗效评估、安全性检测处于国内领先。开展生化指标、遗传标记预测生物制剂疗效和安全性，以及尝试生物制剂减停药方案均处于国内先进。有一整套针对不同病程、不同病情患者的多种传统DMARDs联合治疗方案，得到患者高度赞誉而广为接受。

3．强直性脊柱炎诊治：采用CT、MRI、骨骼肌肉超声结合临床特征大大提高了非放射学改变的中轴脊柱关节炎（早期疾病）的检出率，达到早诊断，早治疗，早恢复、少残疾的效果。生物制剂治疗患者的登记注册研究，长期随访例数、疗效评估、安全性检测处于国内领先。在易感基因的寻找、药物基因组学研究、临床疗效的循证研究等方面积累了丰富临床资料和经验。

4．骨质疏松症：拥有医院唯一的超声骨密度、DXA骨密度检测仪和骨密度治疗仪，是国家卫计委骨质疏松诊疗技术协作基地和卫计委骨质疏松试验基地（上海仅3个），严格遵循国家《糖皮质激素性骨质疏松诊疗指南》（本科为起草单位之一）和《骨质疏松诊断和质量标准》（本科为标准首创单位）的规范开展诊断和治疗，已达到国内一流，上海市领先。

5．系统性红斑狼疮：本科室参与国家十一五科技支撑计划《系统性红斑狼疮的临床诊断、综合治疗的研究（分课题）》的研究，现将依托十二五国家高技术研究发展计划（863计划）重大项目，建立系统性红斑狼疮临床资料和免疫分子资料库，确立免疫分子分型，个体化诊疗技术。开创重危病人抢救新手段：如重症间质性肺炎、肺动脉高压、广泛肺泡出血、急进性肾小球肾炎、急性肾功能衰竭、心力衰竭、多脏器衰竭等，达到上海市先进水平。