新疆民航医院隶属于新疆机场（集团）有限责任公，属非盈利性质，是自治区医保、乌鲁木齐市医保、乌鲁木齐市居民医保、乌鲁木齐市新农合定点医疗机构。医院设有内科、外科、科、妇科、五官科、中医科、软伤科、急诊科、预防接种室等10余个门诊科室，中药房、西药房、检验科、B超室、放射科、心功能室等6个辅助科室，现新增并整合胃肠镜中心、口腔中心、体检中心、中医馆，配有先进的医疗设备。