神经内科为扬州市神经病学专业委员会副主任委员单位，专业现有主任医师1名，主治医师3名，住院医师2名。拥有脑电图及脑地形图、经颅多普勒（TCD）、CT、MRI、动脉硬化检测仪等先进检查设备，开展了亚低温治疗、耐超声治疗等诊疗方法，对各种脑血管病、老年性痴呆、癫痫、帕金森氏病、中枢神经系统感染等疾病的治疗有丰富经验。在脑出血微创颅内血肿清除治疗、缺血性中风超早期溶栓治疗、中风后神经功能康复治疗等方面有独到之处。2006年成立了心理咨询科，对心身疾病心理障碍的诊治有较丰富经验，并拥有多种量表与心理测试方法。