莆田市儿童医院是莆田市唯一的一家儿童专科医院，是福建省儿童救护中心莆田市分中心，2013年12月与莆田市妇幼保健院、圣路加妇产医院共同成立为莆田市妇女儿童医疗保健管理中心。现开设有急诊科、小儿神经康复科、儿内一科、儿内二科、PICU、新生儿科/NICU、小儿外科、手术室、麻醉科、儿童眼科、儿童耳鼻喉科、儿童口腔科、皮肤科等临床科室，担负着全市儿童医疗、保健、急救、科研、教学等工作。

2013年10月29日，莆田学院附属医院医疗集团的成员医院莆田市儿童医院正式揭牌。

莆田市儿童医院现编制床位230床，开放床位280床，现有医护人员266人，其中主任医师11人，副主任6人；护理人员191人 ，主任护师1人，副主任护师8人。整个医疗及护理水平在我市处于领先地位。每年门急诊约45万人次，平均每日门急诊量约1200人次，每年住院约1.4万人次，门诊人均费用约100元，住院人均费用约3700元，药品比例约21%左右，医疗费用、药品比例均低于市卫计委设定标准。

莆田市儿童医院设备齐全，床边X光机（1台）；空气-氧气混合仪吸氧设备（10台）；持续正压通气（CPAP）无创呼吸机（6台）；机械呼吸机（8台）；血气分析仪（1台）；多功能生理监护仪（38台）；便携式监护仪（11台）；氧浓度检测仪（1台）；无创双相正压给氧仪（4台）；床边心电图机（1台）；经皮黄疸测定仪（2台）；微量血糖仪（8台）；喉镜（2套）；婴儿保暖箱（36台）；辐射抢救台（9台）；蓝光治疗仪（27台）；负压吸引器（30台）；心肺复苏抢救装备车（3套）；复苏气囊（20只）；复苏呼吸气囊（16套）；除颤仪（4台）；T-组合复苏器（2台）；微量输液泵及注射泵（85台）；转运车（2辆）；输液加温设备（8台）。