脑病科于2017年12月成为南京市重点专科建设单位。目前共有医生11名，其中主任中医师1名，副主任中医师1名，博士研究生1名，硕士研究生5名。

医院脑病科与南京市第一医院神经内科签订协议，成立“南京市第一医院江宁介入分中心”，“南京市第一医院示范高级卒中江宁分中心”，“南京市第一医院神经内科江宁工作站”，常规开展缺血性脑卒中静脉溶栓技术、脑血管造影（DSA）检查、颅内外动脉支架植入手术等。脑病科在开创进取中积极发挥中医药特色，如刮痧，拔罐，穴位贴敷，耳穴压豆，皮内埋针，中医定向透药治疗，中药熏蒸，温针及电子艾灸等治疗，结合磁疗，激光，超声等先进物理治疗，发挥中西医结合优势。治疗范围包括脑梗死，眩晕病，面瘫，帕金森病，失眠，偏头痛，焦虑抑郁症，癫痫，血管性痴呆，阿尔茨海默病等疾病。此外，脑病科有专职康复治疗师，开展早期偏瘫康复训练，关节松动训练，平衡训练等项目。科室配备站立架，手功能系列训练箱，抽屉式步行阶梯，OT桌等康复设备，及价值20余万的YH-2000多导睡眠监测仪，睡眠呼吸初筛检测仪，用于诊断睡眠-呼吸暂停及睡眠障碍的患者。