外科是以普外、肝胆胰、泌尿为重点的病区。微创手术治疗是其特色和亮点，现有医护人员近40名，其中主任医师三名，副主任医师一名，主治医师八名，住院七名，硕士研究生六名。学术带头人卞建民博士原为南京市第一医院普外科主任、教授、研究生导师，江苏省外科学会胆道学组副组长、肝脏外科学组委员、省中西医结合学会肝脏病学组常委。科室配备德国进口超高清腹腔镜、电子胆道镜、硬质胆道镜、液电碎石仪、瑞士EMS碎石清石系统和前列腺综合治疗仪等高精尖诊疗设备。常规开展腹腔镜胆囊切除术、胆总管探查术、保胆取石（息肉）术、肝囊肿开窗术、肾囊肿减压术、阑尾切除术、疝修补术（TAPP）、输尿管镜和经皮肾镜碎石术、前列腺电切术等微创手术。尤其是腹腔镜微创保胆取石（息肉）术，创区内此项手术先河，尿结石体外震波碎石患者就诊量始终位列全区第一。在卞建民教授带领下，业务能力有了质的飞跃，包括肝癌切除术，胆管癌、胰腺癌的根治切除及术后综合治疗，常规开展肝血管瘤切除以及胆管成型术，急、慢性胰腺炎的诊治，复杂肝胆管结石的诊断和手术治疗等均达到区内先进水平。