首都儿科研究所附属儿童医院是三级甲等医院、爱婴医院、北京大学教学医院、规范化服务达标医院、首都平安示范医院。同时也是北京大学医学部博士、硕士学位研究生培养点，卫生部、北京市住院医师/专科医师培训基地。　　
2002年、2005年医院建设了新门诊楼和病房楼，就诊环境和医疗设施得到极大改善。医院编制床位400张，设有21个临床科室、26个专业、6个临床研究室。住院部设有7个病区和层流病房及百、千级手术室。
研究所和附属儿童医院地处北京市朝阳区雅宝路2号，占地面积28815平方米，建筑面积10万余平方米。全所院现有员工1200余人，其中专业技术人员占84％，具有高级专业技术职称的有120余人。所内有国家级和市级突出贡献专家7人，享受政府特殊津贴的专家22人。
研究所是国务院学位委员会批准的儿科硕士、儿科博士学位授权单位，现有博士生、硕士生导师40余名。目前，已培养博士、硕士200余人，有10名青年科技骨干入选北京市科技新星。科研、临床人员每年在各种核心期刊、学术会议、专业刊物发表论文百余篇，其中SCI文章 30余篇。现有百余名留学人员学成回国。
医院承担着北京市和外省市患儿的医疗救治工作，年门急诊量和出院患者逐年增加，2010年门急诊量达182万人次，日最高门急诊量为5869人次，年出院病人1.4万余人次，年手术7248例。