上海市第三康复医院是上海市第一批建设的康复专科医院，前身系复旦大学附属华山医院永和分院，依托华山医院康复医学的领先优势，医院建设成为“上海百万职工健康管理项目特约体检单位”，上海市闸北区残疾人康复中心，上海市闸北区康复医学质控组长单位。2014年10月10日正式冠名为上海市第三康复医院。医院已连续七届荣获“上海市文明单位”，连续八届荣获“上海市卫生系统文明单位”称号。

作为康复专科医院，细化康复医学二级分科，做到“学科齐全，特色明显”一直是该院发展的宗旨。“十二五”期间医院大力推进康复专科建设，形成二病区为老年康复；三病区为疼痛康复；四病区以开展颅脑外伤、脑卒中等术后气管切开重症患者的神经康复；五病区以骨关节康复和脊髓损伤康复为主的神经康复的特色学科。

在门诊，综合考虑临床医疗与康复医学之间的关系，围绕康复医学大力发展心血管科、呼吸科、推拿科、针灸科、骨伤科等专科，开展专病治疗如慢性阻塞性肺疾患康复、慢性疼痛康复、骨质疏松症康复和糖尿病康复、脑瘫儿童康复等，康复医学得到了快速的发展。

目前医院建成1000平米康复治疗区域，拥有国际先进的康复仪器设备和一流的治疗师团队，开展物理治疗(PT)、作业治疗(OT)、言语治疗(ST)、娱乐治疗(RT)、传统康复治疗、肉毒素注射、食道球囊扩张、关节松动康复治疗等；并进行多种评定，如言语吞咽功能评定、作业日常生活活动能力评定、认知功能评定，并进行神经电生理检查、听力视力检查等。

作为区域内的质控组长单位，医院致力于区域内三级康复体系建设，指导区域内医疗单位康复医学工作，探索制定符合区域特色的康复临床路径等工作规范。