结核科始建于2002年11月，目前拥有一批多年从事结核病研究和治疗的专家，具有治疗各种结核病的丰富经验。现全科实际开放床位50张，医护人员28人,其中副主任医师以上职称3名，主治医师2名，住院医师3名，护师4名，护士16名。装备有中心供氧、中心吸引、中心呼叫系统；拥有简易呼吸器、超声雾化机、心电监护仪及纤维支气管镜及电子支气管镜等设备。

在重症肺结核、大咯血结核性脑膜炎耐药结核病、肺结核合并心衰呼吸衰竭的抢救治疗方面以及在多浆膜腔积液的鉴别诊断肺炎肺结核肺癌鉴别诊断方面具有丰富临床经验对结核性脑膜炎的治愈率高、致残率低。开展了纤维支气管镜下支气管结核的介入治疗，疗效好。

在病人早期发现实行早期联合适量规律全程药物治疗基础上，开展结核病防治业务培训和宣传工作。承担了青海省结核病现患治疗、转诊病人治疗，并开展结核病发病原因、传染途径、预防措施、治疗办法等科学研究工作；承担结核病预防治疗的教学及实习。

全科在各类专业期刊上发表专业论文30篇。开展了10余项新技术、新疗法；目前已发展成为集医疗、教学、科研、预防为一体的全省结核病诊疗中心。

呼吸二科是医院由于结核病人增多，床位增加而于2014年新成立的科室。科室在老住院楼三四楼，核定床位80张。医务人员25人，其中主任医师2人，副主任医师1人，主治医师2人，住院医师3人。所有医师均具有丰富的结核病治疗经验。科主任卓玛，是省级结核病专家，省级学科带头人，中华医学会结核病分会委员，省传染病与寄生虫病分会付主任委员。副主任张润，从事结核病诊断和治疗工作近30年，具有较高的结核病诊疗水平和经验。科室主治各种结核病（呼吸系统、神经系统、消化系统等全身其他脏器结核病）和其他呼吸道疾病。