儿科由住院部、门诊部及输液中心组成，住院部由儿科一区、儿科二区两个区组成。儿科医生近30名，其中有儿科专家6名，主治医师6名。在院领导的重视和努力下，不断引进学科人才，购置医疗器械。经10年的建设，目前急救治疗设备和技术在淡奥地区占优势。其中住院部儿科一区承担儿内科常见病、多发病，儿科急危重病的救治任务及卫生公共突发事件救援工作任务。病房几乎为两人住小病房，所有的病房内均设有洗澡间、厕所，冷暖空调、电视、小储物柜及晒衣区，洗澡间由太阳能热水器定时开放热水。病房环境安静、清洁、空气清新舒适，满足生活基本需求。
儿一区目前开展医疗工作为儿科常见病、多发病的诊疗，积累了丰富的工作经验：1、对各种急性消化道疾病：腹泻病、急性胃肠炎、消化道出血、急性胰腺炎等。2、对呼吸道疾病：毛细支气管炎、细菌性肺炎、哮喘病以及肺炎并心功能衰竭。3、各种抽搐发作性疾病：如脑炎、癫痫、高热惊厥、低钙惊厥。4、血小板减少性紫癜：过敏性紫癜及风湿性、类风湿性关节炎、川崎病等免疫性疾病的诊治。5、肾炎、肾病综合征的诊治。6、手足口病的防治。7、各种药物、食物中毒的救治。8、金黄色葡萄球菌烫伤样皮肤综合征。9、麻疹、水痘、流行性腮腺炎、急性菌痢等传染病的诊治以及其他少见病、疑难杂病的诊治并提供相应的预防、保健。近8年来已开展哮喘专科诊治，近3年来已建立门诊压缩雾化治疗室，在喘息型疾病的治疗上基本达到缩短疗程、疗效满意的目标。病区以氧驱雾化治疗在喘息型肺病：毛细支气管炎、喘息型支气管炎、喘息型肺炎、哮喘持续状态的治疗上取得较为成功的治疗经验，大大提高治愈率及缩短住院疗程，减轻患儿痛苦。
儿科二区的新生儿病区有恒温设施、空气经过消毒，有沐浴室、配奶室、配药室。各项条件均按重症监护病区要求设置，工作环境宽敞、结构按排合理，工作人员均经系统严格专业培训上岗，新生儿住院无需家长陪护。
新生儿科病区经过专业设计，具备相对封闭性、独立性，绝对安全性，不须家长陪护，婴儿交给医护人员治疗护理，家长定时来探视的规范病区。现该区已开展的新技术、新疗法包括：全静脉营养疗法及部分静脉营养疗法，同步整倍换血疗法、部分换血疗法、新生儿新法窒息复苏法，呼吸机机械通气疗法及多层次氧疗法，多层次呼吸道管理疗法，神经生长因子等防治严重脑损伤后遗症疗法，NBNA新生儿神经行为测定技术，早产儿、极低体重儿培育技术。
新生儿危重病治疗成果：成功救治早产儿、极低体重儿700余例，其中体重仅在1000克有4例，小于1500克有700多例。重度窒息并缺氧缺血性脑病、颅内出血和或缺氧缺血性心肌损害、肾功能衰竭1500余例。呼吸窘迫综合征70例，同步整倍换血60例，部分换血30多例。消化道出血并失血性贫血和或休克100余例。新生儿肺炎1000余例，宫内感染200余例，败血症70余例，破伤风20余例。对“无陪重症监护病房（NICU）新生儿家长心理应激反应及对策”的科研项目已结题。
儿二区设置的具体的工作流程和服务如下：新生儿病区为无家长陪护的工作区，办好入院手续的新生儿入室前在处置室按排床位，佩戴新生儿姓名、性别、床号等标识的胸牌及手镯，换上经过消毒的衣被入室。入院后医务人员为新生儿提供的服务包括：除必要的抢救治疗外，每1-3小时换1次尿布、喂1次奶，所有患儿随时处在监视范围，细致的检测每小时一次，其中危重患儿配备多参数监护仪即时检测。每天洗澡、换内衣、称体重各一次；口腔、脐部、会阴皮肤护理至少一次。治疗程序因病而异，病情加重或需特殊治疗时即通知家长到位。患儿病愈，家长应携带住院押金单、身份证及入住协议书，核对相关标识物无误后可办理出院手续。
