吉安市儿童医院口腔科唯一一家专门从事儿童青少年及孕龄妇女口腔疾病预防与治疗的科室。2019成为上海交通大学第九人民医院儿童口腔专科医疗联盟成员

科室拥有8台牙椅，其中5台儿童牙椅，3台成人牙椅。设置有儿童口腔保健科，儿童口腔诊疗室，成人口腔诊疗室，牙周治疗室，口腔门诊手术室（种植室），口腔影像检查室等。配有美国卡瓦口腔及颌面三合一CBCT、美国卡瓦根管治疗机，美国卡瓦热牙胶充填机，瑞士EMS无痛牙周治疗机、法国Sleeperone无痛麻醉仪、3M光固化机、奥地利W＆H种植机等先进设备。

已开展氟保护漆、窝沟封闭、氟化泡沫等儿童龋病预防，可开展乳牙根管治疗，年轻恒牙根尖诱导，牙髓再生术，儿童预成冠，间隙保持，针对儿童特点开展无痛口腔治疗，儿童青少年牙列不齐矫治及早期矫治和隐形矫治，牙外伤，儿童粘膜病等儿童青少年口腔疾病治疗，可开展孕期妇女口腔疾病诊治。针对周围社区开展成人龋病及牙周疾病治疗、修复（烤瓷牙全瓷牙嵌体）、种植、牙列不齐矫治（固定、隐形）及拔牙、门诊口腔手术。

本科室配有空气消毒机，口腔专用消毒设备，严格消毒，严防交叉感染。为全市儿童青少年及孕妇和周围社区群众口腔健康保驾护航