衡阳市第三人民医院是2004年5月由原衡阳市传染病医院（现称北院）和原衡阳市结核病医院（现称南院）合并组建而成。北院坐落在石鼓区草后街182号，其前身为1905年由意大利天主教会创办的百年老院—仁爱医院；

医院占地面积190余亩，编制床位680张，现开放床位460张，现有在职职工528人，专业技术人员467人，其中，高级职称72人，中级职称195人，享受国务院特殊津贴专家1人。

该院是以治疗各类传染病为特色的三级规模专科医院，承担衡阳市及湘南地区传染病医疗救治工作，是衡阳市突发公共卫生事件救治工作的主要成员单位、国家及省中医药管理局中医药治疗传染病基地医院，瑞典卡罗琳斯卡大学和国家CDC项目合作单位全国中医药治疗耐多药结核病科研课题承担单位。开设了肝病科、结核科、中医科、艾滋病科、急性传染病科、综合内科、综合外科、理疗康复科、妇产科、血液净化中心等29个临床医技科室。其中肝病科、结核科、中医科、艾滋病科为湖南省级重点专科。

2019年3月26日，衡阳市人民政府与南华大学正式签约将医院整体划转为南华大学直属附属医院，并授牌南华大学附属公共卫生医院、衡阳市公共卫生临床中心。医院以此为契机，与南华大学深入开展技术协作，互相促进，共同发展，努力建设打造湘南区域医疗中心，更好地发展衡阳市卫生事业，更好地满足人民对健康生活的需求。