1985年建院初期,耳鼻咽喉科医生1名,以治疗耳鼻咽喉常见病为主。年门诊量2000余人,手术只做扁桃体切除术，鼻息肉摘除术等项目,科室只有常规检查设备,89时间有病房,床位1张。1992-1998年增加至4人，2001年开设鼻炎，咽喉炎专科科目。
随着医疗业务的发展，耳鼻咽喉科室在89年从门诊大楼简易病房搬迁至4层楼病房，床位扩大2张，后来又在94年搬至7层病房大楼，床位扩大到4张。2004年又搬至15层病房大楼，2011年又搬至附9病区，床位10张。2013年门诊工作量8.7万人，年收住病人400人。2015年.3月，科室医疗人员8人，其中主任医师1人，副主任中医师1人主治医师4人，医师1人。护理人员1人，主管护师1人，
【科室现状】目前科室有医疗人员8人，其中主任医师1人，副主任中医师1人，主治医师,4人，医师1人，主管护师1人。
【医疗工作】自1985年以来，除开展扁桃体切除、鼻甲切除、鼻息肉切除等一般手术外，后陆续开展了中耳乳突部手术及耳源性颅内外并发症的处理，头颈部先天性疾病和耳、鼻、咽、喉---头颈部良.恶性肿瘤的切除术，中耳炎听力重建术，鼻窦内窥镜手术，頜面部,耳鼻咽喉部的整形美容手术,耳鼻咽喉科多种内窥镜（鼻窦镜、食道镜、纤维鼻咽喉镜,电子喉镜及管硬放大喉镜）检查和手术。2005年以来，该院对慢性鼻炎、过敏性鼻炎，慢性鼻-鼻窦炎、以及慢性咽炎、喉炎，耳鸣、耳聋进行中医的辨证治疗，取得了较好的临床疗效，在昆山地区有一定的影响。
【科研与教学】科室承担着南京中医药大学教学工作，承担耳鼻喉科的理论和临床教学工作。近10年来全科发表论文15余篇。其中SCI论文一篇,2003--2008获昆山卫生局新技术项目一等奖一项，三等奖三项，优秀论文奖一项。科室承担昆山科技局科研课题一项
【硬件建设】现有MiDiMATE622型电测听仪，日本产奥林巴斯纤维喉镜NT3,2001年德国产Wolf-4450.47型硬管放大喉镜，微波治疗仪.手术显微镜，丹麦xf100型声阻抗仪，瑞士彼岸耳科鼻动力系统，Medtronic鼻动力系统，。日本产潘太克斯(PANTEX)3500电子喉镜。
