空军第九八六医院隶属空军军医大学第一附属医院（西京医院），是一所集医疗、教研、保健于一体的三级甲等综合性医院。由原解放军第323、451医院及西安驻军12个门诊部组建而成，分南北两区，南区位于陕西省西安市建设西路6号，北区位于西安市友谊东路269号。

医院是全国卒中中心、国家心血管介入电生理基地和疼痛康复基地、全军腹腔镜治疗中心、干部保健基地、中药研究生培养基地和航空航天医学临床基地，形成了心脑血管介入、腹腔镜微创、肿瘤综合诊治、颈腰椎一体化治疗、血液透析等特色诊疗体系，打造了一批有影响力的特色优势学科。配套设备有320排640层动态容积CT、口腔CT、PET-CT、伽马刀、直线加速器、宾格动力系统、胶囊式数字内镜、真空乳腺旋切系统等各类医疗设备1万余台件，总价值超过5亿多元。

作为西京医院直接管理医院，两院形成了军队紧密医联体，建立了信息互通和门诊专家共享机制，西京医院每周派专家教授到986医院出诊、查房、教学、授课，986医院定期派医务人员到西京医院进修、培训、岗位轮转，两所医院之间建立了良好的技术帮带机制，为医院的学科发展、人才队伍建设起到了积极的促进作用。