舟山医院放射治疗科建于2000年12月，设有X刀治疗中心。目前有专业技术人员6人，其中主任医师1名，主治医师2名，主管物理师1名，主管技师1名，技师1名。
科室配备有德国西门子PrimusM型医用直线加速器，日本东芝模拟定位机，上海拓能治疗计划系统工作站以及全自动热丝切割机。开展全身恶性肿瘤及部分良性肿瘤的放射治疗、立体定向放射治疗（X－刀治疗）、适形放射治疗等。其中适形放射治疗获市卫生局科技推广奖和院级科技进步奖。
1.头颈部肿瘤：鼻咽癌、口腔癌、口咽癌、下咽癌、上颌窦癌、腮腺肿瘤、喉癌、甲状腺癌、颈部转移瘤。
2.胸部肿瘤：肺癌、纵隔肿瘤、食道癌、乳腺癌。3.腹部肿瘤：肝癌、胰腺癌、直肠癌。4.泌尿系统肿瘤：肾癌、膀胱癌、前列腺癌、睾丸恶性肿瘤、阴茎癌。
5.女性生殖系统肿瘤：宫颈癌、子宫内膜癌、卵巢恶性肿瘤、外阴阴道癌。
6.中枢神经系统肿瘤：恶性胶质瘤、髓母细胞瘤、室管膜瘤、颅咽管瘤、脑膜瘤、颅内恶性淋巴瘤。
7.淋巴系统肿瘤：霍奇金病、非霍奇金病、皮肤恶性淋巴瘤。
8.软组织肉瘤，恶性肉芽肿。9.骨肿瘤：骨肉瘤、尤文氏瘤、脊索瘤。10.皮肤癌、恶性黑色素瘤。11.转移性恶性肿瘤：骨转移瘤、脑转移瘤、肺、肝转移瘤等。
12.部分良性肿瘤或疾病：疤痕瘤、垂体瘤、色素沉着绒毛结节性滑膜炎等。
