北京大学深圳医院检验科伴随着北京大学深圳医院的成长不断发展壮大，目前已经发展成为具备专业化学科分组与人员梯队、自动化仪器设备与双向通讯、规范化操作与质量管理、信息化网络流程设计，集医疗、教学、科研为一体的综合性临床检验诊断实验室。总面积3500平方米，科室设有生化、免疫、体液、微生物、血液、分子生物、遗传共7个专业实验室、3个综合实验室、1个前处理室现有员工73人，正式员工45人、临聘人员28人。其中高级职称14人、博士3人，硕士14人，其中在读硕士3人，人员结构合理，学科优势明显。共开展检验项目350余项，日标本量5000余份，为临床诊治提供了重要的依据。
检验科2011年现有设备519台(个)、共计资产原值3600余万元，资产现值近3000万元。拥有奥林巴斯AU5400、AU640、AU1000、强生950等全自动生化分析仪，全自动免疫分析系统、全自动血培养仪、全自动尿沉渣分析仪、全自动血细胞分析工作站、全自动血凝仪、流式细胞仪等先进设备。即将引进的全实验室自动化(totallaboratoryautomation，TLA)流水线，可实现全实验室自动化并进一步推动实验室信息化和标准化进程。检验科全体专业技术人员严格执行规范的操作规程，重视全流程质量控制，保证了从检验前、检验中、到检验后全流程的质量控制。
检验科特色包括产前诊断、分子遗传、流式生殖等特色专业实验室。广东省卫生厅授予检验科广东省规范化性病实验室（三级），承担北京大学深圳医院“产前诊断中心”全部实验室检查部分（如细胞遗传、分子遗传、生化免疫）。其中临床基因扩增(PCR)检验实验室2006年12月28日通过卫生部临检中心的验收，目前已临床应用的基因诊断项目包括：产前诊断项目（地贫基因）、各类病毒（乙肝、丙肝、风疹、单疱病毒、乳头瘤病毒、EB病毒、巨细胞、腺病毒、弓形虫、沙眼衣原体、解脲支原体等）DNA或RNA以及HPV基因分型等，为产前诊断评估、各类病毒感染提供分子水平的诊断。细胞遗传学检验项目包括产前诊断（羊水和脐血培养细胞染色体检查）项目、外周血和骨髓培养细胞染色检查以及常规染色体显带技术（G显带、C显带、N显带等），同时还开展了白血病融合基因荧光原位杂交检测项目（Bcr/Abl、PML/RaRa、AML1/ETO、XY基因），为产前诊断、不孕不育、以及血液系统肿瘤患者的诊断提供充分的依据。流式细胞术检验项目近30项，设计抗原近40种，主要包括各种类型的淋巴细胞免疫表型及亚群分析（T细胞亚群及绝对计数、B细胞及亚群、NK细胞、抑制性T细胞、辅助性T细胞、诱导性T细胞、记忆性T细胞、总活化T细胞、早期活化T细胞、活化T细胞及亚群、变态反应性B细胞、白血病免疫分型、白血病胞浆抗原、CD34＋细胞绝对计数、中性粒细胞CD64抗原、PNH检测（白细胞和红细胞CD59）、细胞DNA周期分析、血细胞（红细胞、白细胞、血小板）自身抗体（IgG/A/M/D）分析，为白血病及微小残留病灶、肿瘤、自身免疫性疾病、变态反应性疾病以及感染和PNH患者的诊断和细胞免疫功能状态的评价提供了良好的依据。男性生殖开展的项目包括精子形态学检查、精子DNA分析、性交后试验、精子低渗肿胀试验、精子顶体酶活性检测等。
除服务于临床外，检验科还承担了教学和科研工作，他们定期举办讲座并承担了北京大学医学部临床医学8年制《实验诊断学》的教学工作，同时承担了中山大学、重庆医科大学、广东医学院等大学医学检验系本科毕业生的实习及课题指导工作，被北京大学医学部评为优秀教研室，并作为广东省专科医师（检验医师）培训基地之一。近年来在SCI、核心期刊、统计源等学术期刊共发表论文180余篇，主编、参编专著10部，承担市级以上课题16项，获科研经费30余万元，并获2项深圳市科技进步一等奖。
质量和服务是检验科永恒的追求，为保证检验报告的公正、准确与及时，以及服务的规范、周到与经济，检验科按照ISO15189的要求建立起质量管理体系并不断完善，严格执行标准操作规程，严格进行室内质量控制，积极参加室间质评，共有127个项目参加了卫生部临床检验中心的室间质评，74个项目参加了广东省临床检验中心的室间质评，自建院以来各项室间质评成绩均为优秀。定期进行不同仪器间检验结果比对和仪器校准，保证检验结果的准确可靠，成为临床疾病的诊治、疗效观察、预后评价中不可缺少的诊治依据。相信随着质量体系的贯彻和不断完善，检验科的工作必将更上一层楼。
