上海市中医医院儿科始建于上世纪50年代初。建设之初只有简单的几间门诊。21世纪初开始在学科带头人虞坚尔教授(博士生导师、享受国务院政府津贴专家)的带领下，快速稳定发展，现儿科门诊、急诊、病房齐备。曾先后立项为上海市中医特色专科(厌食专科)，上海市中医临床优势专科(中医治疗小儿哮喘)，国家中医药管理局 “十一五”重点专科(儿科协作组副组长单位及哮喘协作分组组长单位)，现为国家中医重点专科(儿科协作组组长单位)和国家中医药管理局重点学科。

　　2010年上海市中医医院儿科作为依托单位联合上海中医药大学附属龙华医院儿科、曙光医院儿科、岳阳医院儿科等成立了上海中医药研究院中医儿科研究所，2012年成为上海海派中医流派传承研究徐氏儿科基地和董氏儿科基地。拥有虞坚尔老中医工作室、王霞芳老中医工作室，开设小儿哮喘、反复呼吸道感染、厌食、抽动秽语症、多动症、癫痫等专科，是上海中医药大学优势学科——中医儿科学学科建设的主要依托单位。近年来，在儿童呼吸、消化、营养及内分泌系统疾病防治研究领域取得了较好的建设成绩。在上海中医儿科界处领先地位，在全国业界拥有较高知名度。