中山大学附属第三医院中医科为广东省级中西医结合重点专病中心(中西医结合肝炎肝硬化专科)，世界卫生组织中国乙肝中医药防治培训基地建设项目执行合作单位。国家科技重大专项十一五课题“慢性乙型重型肝炎中西医结合治疗方案优化研究”，“慢性乙型病毒性肝炎病毒携带者的中医药治疗方案”课题协作单位。为中西医结合一级学科博士点。为中华中医药学会感染病分会常委单位。技术力量雄厚中医诊治肝病相关病有特色，病房收治一半多患者来自省内外。中医科有中西医结合病房。有中医肝炎，肝硬化，肝脏保健，专家及专科门诊。为加强中山大学的中西医结合工作中山大学将中山大学中西医结合研究所挂靠中山大学三院中医科。依托医院的省重点肝病实验室和中山大学中西医结合研究所强大的实验室功能和影象学（CT,MRI，超声）病理学设备开展中西医结合基础和临床诊治研究工作。以中西医结合诊断治疗病毒性慢性重症肝炎，肝纤维化肝硬化失代偿合并感染，自发性腹膜炎，胆囊炎，胆道感染，结石，肝吸虫，肝癌，胃肠癌，肿瘤术后，酒精肝，肝炎后及高脂血症，脂肪肝，肝性脑病，乙肝相关肾炎，胃肠炎，内毒素并发症，见各种顽固性黄疸，高转氨酶，低蛋白血症，高AFP血症，面色灰暗，目黄，发热，腹胀，腹胀，腹痛，消瘦，尿少，乏力，头晕，低血压，食欲不振，水肿，胸水，难治性腹水等的诊治研究为国内先进水平。此外中医诊治老年病，消化病，内，妇科，皮肤病，呼吸哮喘疾病，慢性支气管炎，肺气肿，肺心病，风湿类风湿骨关节性疾病，亚健康，高脂血症，高尿酸，糖尿病及其并发症，高血压及其并发症，心脑血管疾病，冠心病，眩晕颈椎病，泌尿系结石，急慢性肾病，不育不孕症均为中医科专长。中医科现有医务人员16人，具正高级职称医师二人，副高级职称医师三人(研究生导师3名)，中级医师8人。培养博士后15人，博士生24人，硕士生37人。中医科为中山大学中西医结合临床硕士学位授予单位。每年都有来自全国各地考取的研究生来中医科攻读学位。同时中医科每年还接受来自全国各地的进修生。

中山大学附属第三医院中医科先后承担和主要参与有关承担国家“973”中医药专项课题1项（负责人），国家自然科学基金课题6项（均为负责人）。发表学术论文200余篇（含SCI8篇），出版专著、教材45部（主编、副主编26部）；获国家科技进步奖二等奖1项（排名第五），教育部和广东省科技成果一等奖各1项（均排名第一）。中西医结合治疗肝病获国家科技重大专项十一五课题“慢性乙型重型肝炎中西医结合治疗方案优化等研究”，“慢性乙型病毒性肝炎病毒携带者的中医药治疗方案”等3项课题的协作单位。国家中医药局及省级课题5项，厅局级十余项，发表和合作发表论文70余篇，主编著作3部，参与出版医学专著3部。多次在国际学术交流大会上演讲。杨宏志，王拥泽等主任医师的中医治疗肝炎肝硬化临床系列研究获中国中西医结合学会科技奖。杨宏志，陈琰碧等主任医师的“补肾益气疏肝凉血活血解毒法治疗肝纤维化远期疗效观察”研究获第四届世界传统医学大会世界传统医药国际金像一等奖。

中山大学附属第三医院中医科带头人还在以下各学术团体，各类杂志任职。包括中国中西医结合学会副会长、中国医师协会中西医结合医师分会委员、广东省中西医结合学会会长、广东省人民医院荣誉教授、广州中医药大学客座教授。中华中医药学会感染病分会常委，广东省中西医结合肝病专业委员会副主任委员，广东省中西医结合综合医院中医专业委员会副主任委员，广东省中医药学会亚健康专业委员会副主任委员，中国中西医结合传染病专业委员会委员，广东省中西医结合感染病专业委员会常委，广东省中西医结合消化专业委员会常委，广东省中医药学会内科专业委员会委员，为中药材杂志中国实验方剂学杂志编委。