1950年9月8日开始，中央人民政府代表张经武随行医疗组、十八军卫生部、重庆支援解放西藏医疗队（称为西南医疗队）、科工队医疗组、中央医疗队（称西北医疗队）共近百名医务人员陆续抵达拉萨。1951年12月26日，从各路进藏医疗队抽调部分人员成立了解放军拉萨门诊部，地址在老城区一个当时称为“联欢社”的地方（原国民党办事处小学），负责人为十八军卫生部医务主任张学彬。

全院设有临床、医技科室和职能、后勤部门50多个，8个科研机构。消化内科、神经外科、肿瘤科、骨外科、内分泌科、神经内科、呼吸内科、检验科等专科。