广州新海医院儿科从建院至今一直为周边社区的广大儿童提供预防保健及疾病诊疗服务，刚建院时仅开设门诊，后来随着业务的发展，开设了独立的儿科病房。2001年成为首都儿科研究所的医疗科研协作医院，医务人员先后到首都儿研所培训学习，近几年业务量逐年提升。现设有儿科病房、普通儿科门诊、新生儿专科、儿童生长发育咨询专科及专家门诊。

广州新海医院儿科对儿童呼吸系统、消化系统、血液系统、新生儿疾病等进行诊治，同时开展儿童生长发育的保健咨询。擅长治疗小儿肺炎、腹泻病、小儿贫血、血小板减少性紫癜、肾病综合征、急性肾小球肾炎、风湿热、川崎病、系统性红斑狼疮及小儿传染病、新生儿缺氧缺血性脑病、早产极低体重儿、颅内出血等儿科疾病。

广州新海医院儿科现有副主任医师2名，主治医师3名。参与广东省科技厅的科研课题——《机械通气对新生儿血小板生长代谢的研究》，省卫生厅的科研课题——《咪唑安定在机械勇气患儿中的应用》，开展了医院立项的科研课题有《肝素钙雾化吸入治疗小儿喘憋性肺炎疗效观察》《小儿喘息性疾病与肺炎支原体感染关系的研究》《抗氧化疗法在心肌炎治疗中的作用》等。儿科建科至今，先后有7名医生到上级医院学习，参加各种业务培训班30多人次，参加全国和全省学术会议20多人次，发表学术论文40多篇。