该院内科消化专业一直紧跟国内先进技术，在上世纪五、六十年代，就开展了胃镜、腹腔镜检查。以后随着胃、肠镜技术的发展，逐步开展了电子胃镜检查和内镜下治疗。消化内科於2008年9月8日建立了新的病区。现有各级医师7名。其中主任医师3名（中华内蒙古医暨消化内镜专科分会常务委员1名）；主治医师2名（带职硕士研究生1名，社招硕士研究生1名）；住院医师2名。拥有日本PANTAX电子内窥镜主机二台；胃镜三条，十二指肠镜一条，结肠镜二条。OLYMPUS-260型电子内窥镜主机一台（已世行贷款定购）；胃镜一条，十二指肠镜一条，结肠镜一条。德国ERBE智能电刀一台。碳十四呼气试验幽门螺杆菌检测仪一台。消化科病房开放床位25张。

消化内科为消化道（食道、胃、十二指肠、小肠、大肠、直肠）和消化腺（肝、胆、胰、脾）等消化器官的疾病诊断与治疗的主要科室。年住院1300例，年门诊量约12800例，其中年内镜检查与治疗近3000例。近年以微创治疗为发展方向。开展了三级甲等医院要求的一般科室项目和重点科室项目9项。其中重点科室项目6项。如贲门失弛缓症的扩张治疗、食道良恶性狭窄的扩张及置放内支架治疗和序贯放疗、食道癌胃癌局部注射化疗药、消化道内镜检查时的黏膜染色、消化道肿瘤的内镜下黏膜切除术（EMR）和黏膜剥离术（ESD）。对消化道出血急诊内镜检查及同时内镜下止血药物喷洒、出血灶黏膜下药物注射、放置钛夹止血等治疗措施。同时在301医院、北医三院、内医附属医院消化内科的帮助下，开展逆行胰胆管造影术（ERCP）+乳头切开术（EST）+胆总管取石术+鼻胆引流术（ENBD）。或胆总管及胰管内置放内支架术。对急性重症胰腺炎施行内镜下乳头切开或置放空肠营养管治疗，均收到良好的疗效。