神经内科成立于1949年，是疆内最早的神经专科之一，是集临床、教学、科研为一体的综合性科室。科室开放床位60张，病区实行责任制整体护理。2012年国家卫计委评定该院为国家级脑卒中筛查与防治基地，卒中筛查及防治工作主要由神经内科担任，2014-2016年连续获得卫健委脑防委“脑卒中高危人群筛查和干预项目先进集体”称号，2017年获得卫健委脑防委“脑卒中高危人群筛查和干预项目先进个人”等称号；2018年中国卒中中心联盟批准该院为高级卒中中心，并先后与玛纳斯县医院和石河子市十一社区卫生服务中心建立“脑卒中专科联盟”；2019年获药物临床试验管理规范（GCP）基地，参与多项国家多中心临床药物试验研究；科室为石河子大学医学院神经病学硕士点，研究方向主要为脑血管病基础与临床。作为住院医师规范化培训基地，科室注重医师临床技能训练，在科研方面参与国家多中心临床脑血管病防治研究工作。神经内科现有医师15人，其中高级职称11人，博士研究生2名，硕士研究生11名。护理人员17名，其中高级职称1名，中级职称8名，护理人员本科学历10人。神经内科有硕士研究生导师6名。
科室注重疑难病例诊治及院内外门诊工作，常年开设神经内科专家门诊和卒中防治门诊，在脑血管病规范诊治、帕金森病早期诊断与治疗、癫痫诊断与识别、面肌痉挛及其他运动障碍肉毒毒素治疗方面有较高水平。
神经内科已经开展了神经系统退行性疾病的诊断与治疗、血管内介入治疗、缺血性卒中的溶栓治疗、重症肌无力危象和格林巴利综合征的抢救和治疗、缺血缺氧性脑病的脑复苏治疗、帕金森病的综合防治、眩晕的分型处理、癫痫和头痛的规范化诊治、各种痴呆的综合防治、焦虑抑郁症的心理治疗、睡眠障碍的综合治疗等具有专科优势的工作。
专科已开展的主要技术项目：①急性缺血性脑血管病评估，开展血管内介入治疗和静脉溶栓：早期溶栓、脑血管造影、CTA、MRA、颈部血管彩超、常规TCD、TCD栓子监测等。②神经电生理检查（肌电图、传导速度、诱发电位、脑电图、睡眠脑电图）：常规神经传导速度、脑电诱发电位、重复神经刺激、瞬目反射、节段神经传导速度、经颅磁刺激治疗等。③神经心理检查：常规认知及心理等量表检查，简易精神状态检查、蒙特利尔认知状态检查、语言流畅性测试(RVR)、日常生活能力测试(ADL)、汉语失语症、视空间功能专项等。④常见神经疾病的分子生物学检查：神经系统遗传代谢性疾病基因检测、神经系统自身免疫疾病抗体检测、结核性脑膜炎的T-SPOT及脑脊液结核杆菌DNA检查等。⑤神经康复：吞咽功能障碍的康复治疗、语言康复治疗、肢体偏瘫功能康复治疗等。
承担了石河子大学本科、研究生、留学生教学、临床见习和实习的教学任务，住院医师规范化培训协同培训基地（神经内科）。神经内科先后承担国家卫健委脑防委脑卒中高危人群筛查与干预项目1项，参加国家“十二五”科技支撑金桥计划子课题1项，主持石河子市课题2项，主持石河子大学课题2项，主持石河子大学医学院第一附属医院院级课题8项。已发表SCI收录论文3篇。主编和参编著作10余部，具有很强的科研实力和良好的科研条件。
