广东省妇幼保健院病理科始建于上世纪八十年代，承担医院的临床诊断、教学及科研的任务。经过30年的努力，现在已经成为在广东省有一定影响力的病理科。每年的组织活检量约30,000余例，液基细胞学30,000余例，尸体解剖100余例，免疫组化8,000项次，分子病理2,000项次。病理科负责基层妇幼保健院的病理医师培训及实习生的教学工作，已经培养实习、进修医师100余名，参与培养研究生30余名。近几年来，病理科获得广东省科技厅及卫生厅科研基金10余项，获科研资助经费50多万元。发表论文100余篇，获得科学技术奖励三等奖。2012年获评为广东省临床重点专科。
人员组成：病理科技术力量雄厚，共有医技术人员21名，其中医生11名，技术人员10名。特聘教授1名，高级职称4人，中级职称3人，博士5名，硕士3名。科室多次选派人员去北京、上海、天津等地区知名医院的病理科进修学习，诊断水平全省领先。
仪器设备：病理科具有国内外的先进仪器与设备，德国Leica冷冻切片机2台、全自动组织脱水机3台，组织包埋机2台，组织切片机2台，全自动染色机2台，全自动封片机1台，罗氏免疫组化仪1台，罗氏原位杂交仪1台，奥林巴斯显微镜7台，荧光显微镜1台，Thinprep2000液基细胞制片仪1台等设备。
科室开展工作：⑴常规病理诊断：手术切除的组织（标本）必须进行病理检查，发报告时间为4个工作日。引进快速病理切片技术，特殊需要的病例发报告时间可缩短至1个工作日。
⑵液基细胞学：该院是最早开展液基细胞学进行宫颈癌筛查的医院，每年筛查人员30,000例左右，其他胸腹水也进行液基细胞学检查。
⑶术中快速冷冻切片：术中需要病理诊断的组织进行快速冷冻切片，确定肿瘤良恶性、浸润深度、切缘的情况等，每年完成3,000例术中冷冻切片，冷冻切片与最终病理诊断符合率99.9%。
⑷免疫组织化学染色：可以鉴别肿瘤良恶性、肿瘤类型、肿瘤免疫表型及癌基因扩张情况，为临床的诊断治疗提供分子依据。
⑸原位杂交：对细胞、组织中的病毒基因、癌基因等进行标记：如HPV病毒，乳腺HER2基因，宫颈癌TERC基因等，为临床靶向治疗提供依据。
⑹DNA倍体分析：通过观察细胞DNA倍体情况，判断细胞的良恶性，两倍体为良性，异倍体考虑恶性，在宫颈癌筛查、胸腹水细胞学检查，肿瘤穿刺细胞学等具有重要的意义。
