儿科为儿科医学专科中心和计划生育优生优育研究所，也是广东省第一个新生儿医学中心，现为博士学位授权点和博士后流动站。展开床位200张，规模列省内教学医院和综合性医院首位，全面开展了儿科学各专业疾病诊治工作，配置有现代化的新生儿重症监护病房（NICU）、儿科重症监护病房（PICU）、血液专业层流病房、神经发育康复治疗园地，设备、规模均居国内领先水平，危重新生儿救治、早产儿监护、PICU、小儿造血干细胞移植和小儿发育与神经康复居国内先进水平，在造血干细胞移植治疗重型地中海贫血方面居国内领先、国际先进水平。危重儿转运网络（TN）为国内最早建立、最完善、辐射最广的陆空立体危重患儿转运网络。发育生物学实验室面积300余m2，设施设备齐全，为国内儿科规模最大的专科实验室。“九五”以来承担国家“863”计划专题、国家“1035”计划专题、国家自然科学基金、国家计划生育科研基金、广东省自然科学基金、广东省科技联合攻关重点课题、广东省医药科技重点课题和广州市科技项目等科研课题16项。
特色医疗：为新生儿科龙头技术和专业制高点。早产微型儿是指早产出生体重不足1500克的极低出生体重儿和不足1000克的超极低出生体重儿，其各器官脏器功能不能适应母体外生存需要，病死率十分高，故其救治成功率为新生儿监护病房（NICU）技术水平的标志。中心NICU设施为国内一流，十余年救治新生儿逾万例，并获1998年医疗成果二等奖。为顺应专业发展趋势，在国内外率先组建了早产儿重症监护病房（PICU）。
即造血干细胞移植治疗，为儿童血液淋巴病科龙头技术和专业制高点，是当前慢性粒细胞白血病、地中海贫血、先天性免疫缺陷病、肝糖原累积症、粘多糖病、高雪氏病等疾病的唯一根治方法；对急性淋巴细胞白血病、淋巴瘤、再生障碍性贫血、实体瘤、自身免疫性疾病等疾病的治疗效果也明显优越于其他疗法。中心儿童血液淋巴病科为台湾慈济骨髓库大陆唯一儿童供髓点，先后成功开展了国内首例脐带血移植（1994年）、骨髓移植治疗地中海贫血（1998年）、外周血干细胞移植治疗α-地中海贫血（2001）和亚洲首例无关供髓治疗重度β地中海贫血（2002年）、异基因骨髓治疗系统性红斑狼疮（2003年）。
为儿童神经发育科龙头技术和专业制高点。在各种原因导致的脑发育不全、脑积水、缺氧缺血性脑病、精神运动发育迟缓，脑炎、脑出血、脑外伤等疾病的恢复期，超早期做出正确的功能评估，在形成固定的神经系统残疾之前给予系统监测和综合治疗。中心儿童神经发育科在国内最先配备规范的多功能小儿神经康复治疗园地，最先提出了小儿神经康复“早期、综合、坚持”的六字原则，深受患儿家长好评。为联合国儿童基金会香港复康会协作培训基地和中国优生优育协会儿童发育专业示范基地。
为儿童重症监护病房（PICU）龙头技术和专业制高点。体外生命支持疗法（ECLS）是一组以体外器官功能替代技术为核心的新兴高科技技术，用于支持病变器官的生理功能，维持机体的生命，提供器官修复的时间窗口，争取疾病得以痊愈的机会。中心已经成功建立了体外膜肺（ECMO）、连续性肾脏替代治疗(CRRT)、亚低温脑保护、人工通气、心脏除颤起搏、介入监护等生命支持的系列技术，八年来治疗脓毒血症、重症病毒感染、中毒、溺水、遗传代谢病等各种原因所至的器官功能衰竭患儿300余例。
为儿童危重病医学体系的功效放大系统。危重疾病儿合理分级救治，能充分有效地利用昂贵而有限的危重病医学技术资源，危重病儿高效、安全的转运系统是其重要保证。中心自二十世纪80年代末，在国内率先开展了危重儿转运网络的实践，摸索出以陆路和航空转运结合、产后转运与产时保驾转运以及宫内转运结合、医训研结合等“三结合“为特征，高层次、立体型、主动综合服务的“珠江模式”；为国内同行提供了成功经验。网络已覆盖整个广东省百余家各级医院，成功远程转运病人逾万名，并获2000年医疗成果二等奖。
