创立于1977年，1994年获硕士学位授予权，2005年获博士学位授予权，2006年成为博士点。原称中国人民解放军第一军医大学第二附属医院，妇产科是全军计划生育优生优育技术研究所。2004年转制，归属于广东省，改称南方医科大学第二临床医学院。

妇产科医护人员66人，其中主系列20人，辅系列46人。包括教授、主任医师1名，副教授、副主任医师7名，主治医师、讲师6名，助教、住院医师6名，职称结构合理。其中博士学位3人、在读博士8人，硕士学位3人、学士学位6人，硕士以上学历占70%。辅系列高级职称2人，中级职称2人，初级职称42人。

科室占地面积5002.72m2，有妇科（977.68m2）、爱婴区、产房（2653.4m2）、门诊（1371.64m2）等4个部门。全科编制床位95张，展开床位120张。拥有宫腔镜、腹腔镜、阴道镜、彩色超声多普勒、盆底康复仪、胎心监护仪、心电监护仪、新生儿抢救台及温箱、产科中央远程监控系统等，价值共计600余万元。

妇产科全年平均门诊量6万多人次，收容量4600余人次，平均住院日6天，全年大、中手术总量1400台次左右，其中妇科内镜手术占85%以上。产科开展了新生儿游泳、新生儿触摸、新生儿神经行为评估、听力评估、产房开展了温馨陪产，无痛分娩，建立了产科中央远程监护中心，进一步提高了围产保健工作的质量。妇科开展了PICC新技术，减轻了化疗病人的痛苦。门诊设立了“不孕不育专病门诊”及“遗传优生咨询专病门诊”，开展了无痛人流、产后盆底康复治疗，增加了孕妇学校的课程内容。