南方医院胸外科历史悠久，技术实力雄厚，经几代人数十年来不懈的努力,已发展成人才梯队结构合理、医教研总体实力先进的临床科室。现有床位68张。我科年手术量超过1000例，门诊量超过6000人次，在国内、港、澳及东南亚知名度高。我科技术力量雄厚，拥有正副教授10人，主治医师3人，住院医师4人，医师均达到硕士以上学历。学科拥有博士、硕士学位授予权，每年招收博士、硕士研究生4-6名。2006年成为国家住院医师临床培训基地及专科医师临床培训基地，每年培训住院医师及专科医师30~50名。

科室以食管疾病、肺部疾病、纵隔疾病的治疗为主，近年来开展了胸腔辅助下的肺大泡、肺肿瘤、食管癌、食管平滑肌瘤的治疗，在国内较早开展全胸腔镜下漏斗胸矫治术（Nuss手术）。

近年来，获国家自然基金、广东省自然基金、广东省重点科技攻关项目、广东省科技计划项目、广东省卫生厅基金多项，先后获全军医疗成果三等奖三次。