上海第二医科大学附属瑞金医院血液学学科于70年代创建，在其奠基人--我国着名的血液学专家，国际肿瘤诱导分化治疗权威，中国工程院院士和法国科学院外籍院士王振义教授的推动下，于1987年，在瑞金医院、仁济医院、新华医院、第九人民医院血液科和二医大病理生理教研室的基础上成立了上海血液学研究所。第一任所长为王振义院士。1996年起至今由国家重点基础研究发展规划（973）和国家高科技研究发展计划（863）的首席科学家、中国科学院院士、中国科学院副院长陈竺研究员担任所长，中国工程院院士陈赛娟研究员、欧阳仁荣、王鸿利和沈志祥教授任副所长。