血液内科为黑龙江省高校重点学科，1959年组建哈尔滨医科大学附属第一医院普内科血液组，至今已有50多年治疗血液系统疾病的历史，1999年正式组建哈医大一院血液内科。

1971年，哈医大一院血液内科在世界上首次应用三氧化二砷（亚砷酸注射液，曾称为“713”注射液）治疗急性早幼粒细胞白血病，取得了世界瞩目的成果，同时亚砷酸注射液被评为国家二类新药。为此，中国科学院《2000年科学发展报告》称此项成果是“二十世纪中国十大科技发明之一”，2008年被评为黑龙江省“改革开放30年十大科技成果”。周晋教授首创“三氧化二砷持续缓慢静脉输注法”获教育部提名国家科学技术进步一等奖，该方法的应用，很大程度上解决了临床中高白细胞血症等难题，大大降低了早期死亡率，取得了突出的社会效益。

血液内科现有病床150张，医护及实验技术人员110人，其中博士生导师3人，正高职9人，副高职11人，年龄结构合理。学科设有国内先进水平的造血干细胞移植病房、淋巴瘤病房、儿童白血病病房、生物细胞诊疗中心和血液内科病房。2001年血液内科被批准为博士点，2005年通过国家临床药理研究基地评估，2006年成为卫生部授权专科医师培训基地，2006年被评为黑龙江省重点学科。2011年被评为国家临床重点专科。

血液内科以白血病、淋巴瘤、多发性骨髓瘤等恶性血液病的临床及实验研究为主，经过十余年的发展，建立了全面的血液病诊疗实验室系统。具有骨髓彩色图象分析系统、流式细胞仪、原位荧光杂交分析系统、实时定量PCR等国际先进的临床检测设备，已成为一个医疗设备先进，集医、教、研为一体的现代化血液病诊疗研究基地，可开展细胞形态学分析、细胞遗传学分析、融合基因检测等临床检测项目。全国各地急性早幼粒细胞性白血病患者不断慕名而来，并得到了满意的治疗，年住院治疗的M3型白血病患者近300例。每年有20余例患者应用血液内科提出的“羟基脲脉冲疗法”治疗慢性粒细胞白血病，显著改善了治疗效果并延长患者生存期。