肛肠科成立于1963年，为国家中医药管理局十二五重点专科建设单位，山东省重点学科，是集医、教、研为一体的中医结合科室。全科共有医护人员20名，其中主任医师1名，副主任医师1名，主治医师3名，住院医师2名，设有门诊、病房、检查室、手术室、换药室、治疗室、熏洗室、理疗室。开放床位34张。年手术1600台次。

肛肠科在全省率先采用美国强生公司新技术PPH治疗环状痔、直肠粘膜内脱垂、直肠前突，效果显著，已成功治愈5000余例患者。2008年4月开展的“肛瘘散”治疗小儿肛瘘，填补了国内专业技术领域的空白，摸索出一套成功的经验。经过几年的努力，肛肠科的治疗技术得到国内同行的高度评价，2009年10月肛肠科主任鞠应东被中华中医药学会评为全国中医肛肠学科名专家，2010年，鞠英东名医工作室被评为全国中医肛肠学科先进名医工作室（站），2010年山东中西医结合专业授予肛肠专业先进集体荣誉称号。2013年12月，科主任鞠英东被聘为山东省五级中医药师承教育指导老师。

科室拥有日本奥林巴斯纤维结肠镜、韩国产电子肛肠镜、LC-200型肛肠检查治疗系统、生物反馈仪、肛肠动力监测系统、全自动水疗仪、红光治疗仪、扩肛按摩仪、动能熏蒸治疗机、高频电刀、外科多功能治疗仪、心电监护仪、周林频谱仪、镇痛泵、PPH、TST等先进检查治疗设备，能快速准确的治疗大肠、肛门的常见病及疑难病。门诊每天安排男女专家应诊，全方位、全天候为患者提供服务。