北京大学第三医院心内科成立于1958年，是教育部重点学科和全国知名的心血管疾病诊疗、科研和教学单位。开放床位94张，心脏监护病房床位16张。是国家级冠心病介入治疗、起搏电生理和心脏康复培训基地，也是国家胸痛中心、心衰中心和房颤中心建设单位。心内科-血管医学研究所是心血管分子生物学与调节肽卫健委重点实验室（入选国家临床重点专科建设项目）和心血管受体研究北京市重点实验室。

心血管内科现有职工141人（含非在编26人），其中正高职称专家24人，副高职专家15人，专职科研人员7人，42人具有博士学位。心血管内科为博士后流动站，现有博士生导师10人。拥有中科院院士韩启德，陈明哲、郭静萱、毛节明、陈凤荣等心血管病知名专家。在现任科室领导高炜、张幼怡等带领下，医教研全面发展。

心血管内科是全国最先开展冠状动脉介入诊疗的单位之一，1988年在国内进行了第一例激光冠脉成形术。年冠心病介入治疗1000余例，基于影像和FFR功能学评估的介入治疗及小切口分站式冠脉杂交手术国内领先。率先开展了微创心室折叠减容术和经心尖微创主动脉瓣置换术（TAVR）等新技术。三维标测指导下高龄复杂患者的房射频消融治疗经验丰富，并开展了房颤射频消融术+左心耳封堵“一站式“手术。超声心动图年检例次超过5万例，在运动员心脏的超声和磁共振评估方面具有优势和特色。心血管内科是国内最先开展和引领心脏运动康复的医院之一。冠心病介入术后，心脏康复，高血压病，心力衰竭，房颤及抗凝、起博门诊，“心风险”术前评估，妊娠高血压门诊等特色门诊，方便更多患者得到专业化，规范化的治疗。心血管护理团队是“全国青年文明号病房”和”心血管病专科护理及技术培训基地。

临床和科研相结合的冠心病和心衰转化医学研究成果显著，承担多项国家和省部级重点项目，现有国家自然科学基金“杰出青年”1名，张幼怡和徐明作为主要完成人荣获国家自然科学奖二等奖。