营养部作为医院的医技科室正式成立于1985年8月8日，包括营养技术人员和炊事人员两部分。1986年丁兰作为营养技术人员被正式任命为营养部副主任，主抓业务工作；1987年于明华被任命为营养部主任，主抓行政工作。1988年，营养部开始接收北医卫生系分配来的大学生，除了开展营养部的常规工作外，还接受兄弟医院营养技术人员的进修，很好地完成了北医三院卫生学校的营养学讲课任务。1997年，配合内分泌科参与了中华医学基金课题《2型糖尿病人的门诊强化治疗》的科研工作。1999年4月，营养技术人员与营养食堂的炊事人员正式分开，营养食堂的炊事员成立一个独立的科室，直属总务处管理，现在的营养部仅限于营养技术人员，仍为医院的医技科室，现有专业人员4人，其中副主任营养师1人，主管营养师1人，营养师2人。

营养部主要负责住院病人的营养风险筛查、营养指导、营养咨询、营养会诊、危重病人的肠内营养支持以及其它需要饮食治疗病人的管理，负责各种治疗食谱的编制，促进营养治疗在临床综合治疗中的合理应用。还负责门诊病人的营养咨询，营养科有独立的营养咨询门诊主要针对孕妇、糖尿病患者、妊娠合并糖尿病患者、肾衰患者、血透或腹透患者、消化性溃疡患者、肥胖患者、高脂血症患者以及痛风患者等需要特殊饮食指导者，纠正其不良饮食习惯，给予正确饮食指导及配方，帮助病人尽快恢复健康。

除了开展营养部的常规工作外，还接受兄弟医院营养技术人员的进修，承担北京大学医学部部分营养教学工作。在科研方面，营养科参与了内分泌科中华医学基金课题《2型糖尿病人的门诊强化治疗》的工作；2006年以来参与了北京市科委关于《北京糖尿病前期干预和逆转研究》的科研课题。以第一、第二作者的身份在核心期刊上发表了多篇论著。还参与多部教材的编写工作，主要有高等医学院校护理学专业教材《临床营养学》、《临床营养学实习指导》，全国高等教育自学考试指导委员会的专业教材《临床营养学》、《疾病的营养防治》以及人民卫生出版社《抗衰老内科学》等。

营养部作为医院的医技科室，积极开展对外联系，加强了与各大医院营养科之间的联系，积极参加营养学会组织的各项活动：为中国营养学会举办的全国营养师培训班讲课；参与了全国营养师资格考试题库的编写工作；接受了兄弟医院营养人员的进修学习；圆满完成了卫生部组织的宁夏、青海西部营养师的培训任务；作为第一副主编参与了高等医学院校护理学专业教材《临床营养学》以及《临床营养学实习指导》的编写工作；并参与了全国高等教育自学考试指导委员会关于专业教材《临床营养学》的编写工作；参与了医院治疗膳食标准及操作规程的制定工作；积极参与北京大学糖尿病中心组织的大型糖尿病健康咨询活动；参与了卫生部组织的卫生专业技术资格考试指南《临床营养学》的部分编写工作；参与了卫生部组织的卫生专业技术资格考试命题和审题工作；同时他们还十分注重营养学和疾病营养治疗的科普工作，以第一、第二作者的身份在核心期刊上发表了多篇论著；多次参加电视台、广播电台及报刊的健康宣教节目。营养科主任现任北京市营养学会理事，中国医师协会营养医师专业委员会委员。中华医学会临床营养学分会委员。