广东东莞治疗自闭症比较好的二级医院包括广州医科大学附属脑科医院、深圳市康宁医院.榜单医院是博禾医院库基于复旦医院排行榜、省市卫健委、卫生部以及医院等级评级和当地影响力综合产生。广州医科大学附属脑科医院是全国精神医学科医院排行榜第7位、深圳市康宁医院是全国精神医学科医院排行榜第10位。
全国精神医学科医院排行榜第7名:广州医科大学附属脑科医院（广州市惠爱医院、广州市脑科医院、广州市精神卫生中心）坐落于珠江南岸，白鹅潭畔，由美国医生嘉·约翰（John Kerr）于1898年创办，是华南地区最大的三级甲等脑科医院。
全国精神医学科医院排行榜第10名:深圳市康宁医院始建于1980年，是深圳市唯一一家集预防、医疗、康复、科研、教学于一体的三级甲等精神病专科医院，2007年医院加挂深圳市精神卫生中心，承担全市精神卫生防治和康复技术指导。
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