全国治疗卵巢囊肿比较好的三甲医院包括广州市妇女儿童医疗中心、复旦大学附属妇产科医院、浙江大学医学院附属妇产科医院、重庆市妇幼保健院、上海市第一妇婴保健院.榜单医院是博禾医院库基于复旦医院排行榜、省市卫健委、卫生部以及医院等级评级和当地影响力综合产生。广州市妇女儿童医疗中心是全国医院综合实力排行榜第74位、复旦大学附属妇产科医院是全国医院综合实力排行榜第90位、浙江大学医学院附属妇产科医院是全国医院综合实力排行榜第92位、重庆市妇幼保健院是全国生殖医学科医院排行榜第7位、上海市第一妇婴保健院是华东区妇产科医院排行榜第5位。
全国医院综合实力排行榜第74名:广州市妇女儿童医疗中心（以下简称“妇儿中心”）是集预防、医疗、保健、科研、教学为一体，形成了多专业、跨学科医疗保健立体服务体系的医疗机构。也是广东省唯一进入全国前百名医院的妇幼保健机构。
全国医院综合实力排行榜第90名:复旦大学附属妇产科医院设有普通妇科、妇科肿瘤科中西医结合妇科、妇科内分泌与生殖医学科宫颈与阴道早期疾病诊治中心、宫腔及输卵管疾病诊治中心、产前诊断与胎儿医学科、计划生育科、母体病理产科、普通生理科、新生儿科、乳腺科等多个全国领先优势科室。
全国医院综合实力排行榜第92名:浙江大学医学院附属妇产科医院（浙江省妇女保健院、浙江省妇女医院）是浙江省妇产科医疗、教学、科研及计划生育、妇女保健工作的指导中心，是在华东区乃至全国有较大影响力的三级甲等妇产科专科医院。
全国生殖医学科医院排行榜第7名:重庆市妇幼保健院（重庆医科大学附属妇女儿童医院 、重庆市妇产科医院、重庆市遗传与生殖研究所）创建于1944年，是一所集临床医疗、妇幼保健、科研教学为一体的三级甲等妇幼保健院。
华东区妇产科医院排行榜第5名:上海市第一妇婴保健院创建于1947年2月，是我国最早成立的省市级妇幼保健院之一。1995年被评为三级甲等专科医院。2006年成为同济大学附属第一妇婴保健院。是上海市文明单位、上海市干部保健指定单位。
