消化内科是医院的重点科室，包括病房、门诊、消化实验及内窥镜室。科室额定床位数45张。现有医护人员32人，主任医师4名，副主任医师2名，硕士研究生8名，每年住院病人约1600人次，每年门诊量约2万人次。常规开展了电子胃镜、结肠镜检查、无痛胃肠镜检查术、内镜异物取出术、经内镜胃肠道息肉电切术、小肠气钡双重造影等。同时还开展了内镜下食道曲张静脉套扎术、组织胶硬化剂注射等上消化道止血治疗，B超引导下经皮肝内胆管穿刺引流术（PTCD）,内镜下逆行胰胆管造影术（ERCP），内镜下逆行阑尾炎治疗术（ERAT）、内镜下消化道支架置入、空肠营养管置入、内镜下胃造瘘等新技术，均填补了市内空白，达省内先进水平。近年发表国家、省级医学论文40余篇，4项课题研究获吉安市科技进步二、三等奖。