中国医学科学院肿瘤医院妇瘤科创建于1958年，目前是全国最大的妇科肿瘤综合治疗中心之一。科室拥有临床工作人员100余人，其中包括主任医师8人，副主任医师10人。主要开展对宫颈癌、卵巢癌、子宫内膜癌、外阴癌、阴道癌等恶性肿瘤以及各种妇科良性肿瘤的专科诊疗。目前设有病床130张，分为三个病房，另设妇科后装放射治疗中心。门诊量5万余人次/年，手术量2000余台/年，放疗800余例/年，化疗1万余例次/年。

妇瘤大型手术（如广泛子宫切除、盆腹腔淋巴结清扫、卵巢癌肿瘤细胞减灭及外阴癌根治等）是科室的主要优势项目。近十年来科室大力发展微创技术，使更多的根治性手术借助腹腔镜完成，大幅提高了手术质量，并促进了患者术后恢复，腹腔镜根治性手术逐步成为科室的特色治疗。自60年代以来，宫颈癌放射治疗一直是妇科的主要专长，曾多次获得国家级奖项。近年又开展了适形调强放疗、三维后装治疗等新技术，使妇科肿瘤放疗稳居国内领先地位。科室的最主要特色是综合采用手术、放化疗等多种手段，给予患者最为合理化的治疗，从而使宫颈癌等常见妇科恶性肿瘤5年生存率稳居全国前列。

妇瘤科为国家肿瘤学重点学科，承担了多项国家、省部级课题，包括宫颈癌和癌前病变的预防和治疗的研究、卵巢癌的抗肿瘤药物的临床研究，以及妇科肿瘤基因及转化医学研究等。该科是北京协和医学院博士、硕士学位授予点，目前有博士生导师2名，硕士生导师4名。另外，每年接收全国进修医生的短期参观学习和半年、1年的进修学习。每年承办国家级及北京市妇科肿瘤学习班等继教项目。