内分泌风湿免疫科是集医疗、教学、科研为一体的综合性科室。科室住院病房位于干部医疗保健楼三层北区，展开床位52张，现有副主任医师2名，医技护人员30余名。科室近年来承担多项国家自然科学基金及军队、地方医疗卫生科研课题。科室主任即学科带头人申晶，医学博士，副主任医师。

目前科室开展包括各种类型糖尿病、糖尿病及其急慢性并发症、甲状腺、甲状旁腺、肾上腺、垂体、代谢紊乱（高脂血症、痛风、脂肪肝）、肥胖症、类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮、强直性脊柱炎、结缔组织病等疾病的诊疗。在内分泌危重及疑难病诊治、抢救方面积累了丰富的临床经验。近年来科室还展开“基于精细血糖控制平台的特殊人群（器官移植术后患者、结核感染合并糖尿病患者、围手术期患者）血糖管理”、“妊娠期糖尿病管理”、“超重及肥胖2型糖尿病患者非手术减重综合治疗管理”等，取得了非常显著的社会和经济效益。